More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1172 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 353 aa  701    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  74.57 
 
 		 354 aa  518  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  72.78 
 
 		 353 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  70.57 
 
 		 354 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  71.02 
 
 		 351 aa  484  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  66.76 
 
 		 354 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.09 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  64.04 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.46 
 
 		 367 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.69 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.71 
 
 		 357 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.45 
 
 		 374 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.46 
 
 		 371 aa  415  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.78 
 
 		 378 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.72 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.36 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.95 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.86 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.77 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.77 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.17 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.73 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.03 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.41 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.51 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.51 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.51 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.87 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.26 
 
 		 354 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.46 
 
 		 356 aa  371  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.98 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.64 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.59 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.88 
 
 		 378 aa  355  5.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.94 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.43 
 
 		 401 aa  310  2e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.46 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  46 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.62 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.55 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.27 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.44 
 
 		 368 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.89 
 
 		 361 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  38.25 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  29.26 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.83 
 
 		 387 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  31.56 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  31.21 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  31.94 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.12 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  30.69 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  30.03 
 
 		 406 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.9 
 
 		 416 aa  95.9  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.94 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.78 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.61 
 
 		 392 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.01 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.73 
 
 		 412 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  29.97 
 
 		 364 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.59 
 
 		 413 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  30.7 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  31.82 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  29.25 
 
 		 377 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  30.32 
 
 		 391 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  30.41 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  29.6 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.21 
 
 		 375 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  29.84 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  31.56 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.81 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  26.33 
 
 		 419 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.66 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  25.78 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  30.31 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  31.23 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  30.91 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.94 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  31.99 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.94 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.32 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  26.93 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  26.7 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  28.34 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.02 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  27.56 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.42 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  24.61 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  24.85 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.74 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.28 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  30.12 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  29.23 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.67 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  26.59 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  30.45 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  29.39 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>