More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5500 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 358 aa  725    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.82 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.11 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.43 
 
 		 367 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.4 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.85 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.93 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.94 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.21 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.92 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1160  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.68 
 
 		 369 aa  404  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  59.89 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  59.14 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.81 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.06 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.81 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1172  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.72 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.81 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.05 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  60.28 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.94 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.12 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.32 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06290  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.26 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7949  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.21 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.73 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.91 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.79 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.06 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3315  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.31 
 
 		 364 aa  361  8e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.621792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.95 
 
 		 378 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.46 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.06 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.09 
 
 		 401 aa  323  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.72 
 
 		 378 aa  319  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.84 
 
 		 370 aa  316  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.67 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.57 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  39.43 
 
 		 344 aa  205  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.9 
 
 		 354 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.99 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.99 
 
 		 368 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.58 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  37.36 
 
 		 368 aa  185  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  30.46 
 
 		 378 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  30.57 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.03 
 
 		 387 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.79 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  24.21 
 
 		 422 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  25 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 385 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.32 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  29.74 
 
 		 377 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  28.13 
 
 		 380 aa  92.8  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.7 
 
 		 413 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  28.49 
 
 		 446 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  26.98 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  24.69 
 
 		 422 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 		 422 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 		 422 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 		 422 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  29.39 
 
 		 337 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.54 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.53 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  25.15 
 
 		 422 aa  89.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  24.94 
 
 		 422 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  26.76 
 
 		 422 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.42 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 422 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.3 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  26.69 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.25 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 		 416 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  29.39 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.74 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.49 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.3 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.69 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  26.77 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  29.22 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.1 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  30.39 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  23.66 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.79 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.97 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.95 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.19 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.4 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  30.29 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  26.22 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.35 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.92 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.97 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  21.94 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.98 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  29.13 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  31.06 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>