More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2738 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  100 
 
 
360 aa  709    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.08 
 
 
378 aa  389  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3165  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.03 
 
 
367 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.608359 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0789  peptidase M20  55.97 
 
 
381 aa  318  7e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0672  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.88 
 
 
407 aa  316  3e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.573003  normal  0.0211089 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.25 
 
 
338 aa  110  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  36.09 
 
 
335 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  26.93 
 
 
391 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.4 
 
 
335 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.62 
 
 
389 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  30.61 
 
 
389 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  36.28 
 
 
335 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  32.26 
 
 
349 aa  100  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  32.39 
 
 
368 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  29.46 
 
 
412 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
389 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
389 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  31.06 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
405 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
405 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
405 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
405 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  29.64 
 
 
388 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  29.4 
 
 
405 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
586 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  32.72 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.56 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.01 
 
 
383 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 
383 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 
383 aa  94  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  29.58 
 
 
409 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 
383 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 
383 aa  93.2  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 
383 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  29.01 
 
 
383 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  32.16 
 
 
402 aa  92.4  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  28.45 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  29.55 
 
 
337 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.44 
 
 
375 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  28.73 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  28.23 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.36 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  28.37 
 
 
387 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  29.83 
 
 
385 aa  89.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 
382 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  29.13 
 
 
406 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  29.13 
 
 
406 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.79 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  26.64 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  28.98 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.91 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  28.99 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.79 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  29.54 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  28.73 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  27.33 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  29.02 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  28.25 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.46 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  28.5 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  26.93 
 
 
392 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.75 
 
 
395 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 
397 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.75 
 
 
395 aa  87  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 
380 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 
388 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  25.08 
 
 
341 aa  86.3  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  29.16 
 
 
397 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  28.93 
 
 
380 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.3 
 
 
384 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  28.74 
 
 
406 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  29.61 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  29.15 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.45 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  27 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  29.29 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  28.69 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  32.49 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  26.27 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.87 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  27.98 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  28.42 
 
 
385 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.2 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  28.33 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.75 
 
 
447 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  28.35 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  27.84 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  27.75 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.51 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  27.45 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  26.19 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.98 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>