More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1192 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  98.36 
 
 
365 aa  735    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
365 aa  747    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0688  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  98.08 
 
 
365 aa  736    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  79.23 
 
 
366 aa  593  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  66.03 
 
 
365 aa  499  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  65.83 
 
 
363 aa  472  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  61.92 
 
 
365 aa  448  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0240  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.34 
 
 
367 aa  419  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.63 
 
 
365 aa  412  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.74 
 
 
370 aa  391  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.58 
 
 
376 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.1 
 
 
378 aa  262  8e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.71 
 
 
377 aa  259  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.33 
 
 
385 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.75 
 
 
378 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1271  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.49 
 
 
392 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.3 
 
 
387 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.83 
 
 
391 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.84 
 
 
376 aa  249  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.1 
 
 
391 aa  249  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.77 
 
 
379 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.92 
 
 
379 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.6 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.21 
 
 
375 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.1 
 
 
386 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.6 
 
 
378 aa  242  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.58 
 
 
375 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.34 
 
 
398 aa  242  9e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.56 
 
 
375 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6045  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.05 
 
 
379 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.790399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2032  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.05 
 
 
379 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460385  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0277  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.29 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2051  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.26 
 
 
379 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0095  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.56 
 
 
377 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.81 
 
 
374 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1420  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.32 
 
 
383 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000737808  normal  0.0270135 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.81 
 
 
374 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1668  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.7 
 
 
401 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0474135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1245  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.99 
 
 
379 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.95 
 
 
375 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.14 
 
 
385 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1933  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.62 
 
 
379 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.04 
 
 
380 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2014  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.26 
 
 
383 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.466728  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.62 
 
 
379 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.24 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5341  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.36 
 
 
379 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964134  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.03 
 
 
375 aa  236  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.16 
 
 
407 aa  235  9e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.72 
 
 
402 aa  235  9e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.6 
 
 
382 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2451  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.73 
 
 
379 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.684558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2507  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.73 
 
 
379 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.6 
 
 
382 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2482  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 
389 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1531  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.57 
 
 
371 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.04 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.3 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0557  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.86 
 
 
386 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.59 
 
 
375 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1343  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.47 
 
 
379 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1568  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.47 
 
 
379 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.03 
 
 
375 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3241  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.47 
 
 
379 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2071  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.47 
 
 
379 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.03 
 
 
375 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.31 
 
 
375 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.27 
 
 
386 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2596  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.47 
 
 
383 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.02 
 
 
383 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.16 
 
 
407 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0081  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.66 
 
 
377 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.12 
 
 
382 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.14 
 
 
425 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1263  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.5 
 
 
386 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103689  normal  0.466202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.43 
 
 
388 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.68 
 
 
375 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.69 
 
 
389 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.86 
 
 
383 aa  229  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1862  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.59 
 
 
376 aa  228  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000241136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.24 
 
 
387 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.46 
 
 
380 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.473063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2019  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.85 
 
 
377 aa  227  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.08 
 
 
377 aa  227  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1327  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.5 
 
 
383 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158007  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.55 
 
 
395 aa  227  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.98 
 
 
377 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.55 
 
 
395 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0948  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.56 
 
 
377 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.26 
 
 
391 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.31 
 
 
377 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.78 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2470  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.19 
 
 
380 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00847211  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2367  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.19 
 
 
380 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0319493  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1992  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.19 
 
 
380 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0274072  hitchhiker  0.000000073122 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.5 
 
 
377 aa  225  9e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1857  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.92 
 
 
381 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2123  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.34 
 
 
379 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2518  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.66 
 
 
382 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00740773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2121  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.92 
 
 
381 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>