More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3265 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3265  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 416 aa  850    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.366543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0881  acetylornithine deacetylase  57.04 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477739  normal  0.0291796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.02 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.63 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  27.76 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3717  acetylornithine deacetylase  28.02 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0025  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.73 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  27.51 
 
 		 446 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.8 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  26.17 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.34 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.48 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  23.53 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  23.99 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  23.76 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  23.98 
 
 		 422 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  23.98 
 
 		 422 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  23.98 
 
 		 422 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  23.98 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.42 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  23.82 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.72 
 
 		 447 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  28.28 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  26.04 
 
 		 753 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.65 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  23.04 
 
 		 422 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  23.6 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.03 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0949  peptidase M20  25.76 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0792723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2502  acetylornithine deacetylase  29.8 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  29.64 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  25.31 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  30.09 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  25.18 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  26.72 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  26.33 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.12 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.77 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.46 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  25.96 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.81 
 
 		 424 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  22.87 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.57 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  22.57 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  23.24 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  23.24 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  26.08 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.79 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  27.97 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  23.47 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  23 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  28.27 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  22.12 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  23.24 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  22.89 
 
 		 394 aa  86.7  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.98 
 
 		 416 aa  86.3  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  26.03 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  27.51 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0548  acetylornithine deacetylase  23 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  24.82 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  28.24 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  26.54 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  26.7 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  27.97 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  24.33 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  24.86 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.07 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1489  peptidase M20  25.87 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0188879  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  25 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  24.5 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  28.37 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  25.24 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0346  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0940118 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.46 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  27.46 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  29.33 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  27.25 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  22.85 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  28.24 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  28.37 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  28.37 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.95 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.01 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0412  acetylornithine deacetylase  22.25 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  25.42 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>