More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0916 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 423 aa  853    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.94 
 
 		 419 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.7 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.7 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.52 
 
 		 409 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  54.99 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  51.47 
 
 		 409 aa  418  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  54.99 
 
 		 424 aa  415  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.13 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.52 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  54.99 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  52.59 
 
 		 411 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.49 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.91 
 
 		 409 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  54.14 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  54.14 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  50.25 
 
 		 413 aa  398  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  52.62 
 
 		 411 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  51.76 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  48.25 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  54.64 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.12 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  48.83 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  48.58 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1106  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.8 
 
 		 184 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802488  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 		 410 aa  151  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.13 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.19 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.51 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 		 442 aa  143  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.04 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.79 
 
 		 431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.32 
 
 		 435 aa  126  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.64 
 
 		 423 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.64 
 
 		 439 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.95 
 
 		 423 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.91 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  33.13 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.68 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.63 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  29.38 
 
 		 380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  29.76 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.03 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  32.51 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  33.42 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.11 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.85 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  32.81 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.4 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.68 
 
 		 400 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  28.49 
 
 		 404 aa  106  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.01 
 
 		 395 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  32.08 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  28 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  32.33 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.04 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  30.49 
 
 		 387 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.47 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  33.64 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  30.18 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  31.69 
 
 		 386 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.62 
 
 		 391 aa  103  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  31.76 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.48 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  30.38 
 
 		 364 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.98 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.37 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  31.87 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  33.02 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  25.19 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  29.19 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.27 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  29.24 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  32.72 
 
 		 387 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.28 
 
 		 388 aa  99.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.23 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  30.36 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  24.69 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  30.18 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.12 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.09 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  30.89 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  31.5 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  28.93 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  30 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.15 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.32 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.85 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.24 
 
 		 385 aa  96.7  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.77 
 
 		 388 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  29.48 
 
 		 386 aa  96.3  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  29.79 
 
 		 364 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1823  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 		 369 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.248504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  32.75 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  30.99 
 
 		 369 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  29.21 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  29.55 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>