More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6288 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6288  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  100 
 
 
361 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0317  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  41.31 
 
 
348 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2180  acetyl-lysine deacetylase  41.91 
 
 
348 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.749889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3459  acetyl-lysine deacetylase  43.64 
 
 
352 aa  239  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2723  acetyl-lysine deacetylase  42.12 
 
 
366 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1391  acetyl-lysine deacetylase  42.49 
 
 
358 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.971431  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  39.71 
 
 
355 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0347  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  40.06 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  40.17 
 
 
351 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0776  acetyl-lysine deacetylase  37.43 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2612  acetyl-lysine deacetylase  36.54 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.880671  normal  0.701984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0324  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  37.39 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1498  acetyl-lysine deacetylase  36.29 
 
 
358 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1757  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  35.69 
 
 
383 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  32.09 
 
 
375 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1139  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.86 
 
 
346 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0335688  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  33.92 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  33.53 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.11 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  34.11 
 
 
335 aa  126  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0170  acetyl-lysine deacetylase  32.41 
 
 
345 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000443828  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0451  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  33.04 
 
 
346 aa  123  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  30.46 
 
 
394 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  31.4 
 
 
400 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  37.5 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.19 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.15 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.69 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.22 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.86 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.86 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  25.65 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.86 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  28.73 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.92 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  27.53 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.52 
 
 
375 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.46 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  29.11 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.86 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.51 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3165  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.11 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.608359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  27.79 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  26.69 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  26.97 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  28.46 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  24.16 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1523  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.03 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.97 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.43 
 
 
395 aa  69.3  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  33.33 
 
 
452 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.07 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  28.85 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  28.18 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.68 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.68 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  28.26 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  26.42 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.79 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 
398 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  27.18 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.14 
 
 
359 aa  67  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1088  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.79 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0935088  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  26.18 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  26.98 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.16 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  26.87 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  28.03 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  28.5 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.29 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.99 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  25.59 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1647  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.73 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02363  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.14 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.14 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.14 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  30.14 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  27.58 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.14 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.38 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.14 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  28.96 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.14 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.14 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.14 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.04 
 
 
414 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  25.43 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.91 
 
 
354 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.56 
 
 
405 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.28 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0240  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.07 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.74 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>