More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3459 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3459  acetyl-lysine deacetylase  100 
 
 
352 aa  708    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2723  acetyl-lysine deacetylase  83.81 
 
 
366 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2180  acetyl-lysine deacetylase  56.94 
 
 
348 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.749889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0317  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  53.06 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  48.97 
 
 
351 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0347  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  51.44 
 
 
366 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  49.57 
 
 
355 aa  296  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1391  acetyl-lysine deacetylase  48.07 
 
 
358 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.971431  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6288  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  43.35 
 
 
361 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0776  acetyl-lysine deacetylase  38 
 
 
351 aa  209  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1498  acetyl-lysine deacetylase  36.74 
 
 
358 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2612  acetyl-lysine deacetylase  35.59 
 
 
387 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.880671  normal  0.701984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0324  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  36.47 
 
 
356 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  32.4 
 
 
375 aa  173  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1757  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  33.88 
 
 
383 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0451  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  32.86 
 
 
346 aa  153  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.53 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.3 
 
 
338 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1139  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.65 
 
 
346 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0335688  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.62 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.65 
 
 
349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0170  acetyl-lysine deacetylase  28.7 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000443828  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  29.21 
 
 
335 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  28.85 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  25.45 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  23.75 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.46 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  27.25 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3178  peptidase M20  28.53 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  24.16 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.95 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  37.36 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  26.32 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.47 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  29.63 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1085  peptidase M20  28.88 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000939958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.37 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  25.97 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  26.47 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.14 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.89 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.26 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.85 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.95 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0095  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.34 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.95 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.06 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.26 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  23.04 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.95 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  26.91 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  25 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.9 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.46 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.4 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.86 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.96 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.4 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  26.72 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.25 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.93 
 
 
429 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4515  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.53 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113007  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  23.56 
 
 
391 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.21 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.15 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.17 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.19 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  26.84 
 
 
388 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.95 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.75 
 
 
395 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3165  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.3 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.608359 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  31.61 
 
 
413 aa  63.9  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0874  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.8 
 
 
376 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254055  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.35 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.97 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  23.47 
 
 
402 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02363  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.14 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  28.14 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.14 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.14 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.14 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.14 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.14 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.14 
 
 
375 aa  63.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.55 
 
 
381 aa  63.2  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.55 
 
 
422 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0081  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 
377 aa  62.8  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.07 
 
 
397 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  27.42 
 
 
364 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.89 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  31.25 
 
 
460 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  28.51 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.89 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.29 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.99 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.56 
 
 
389 aa  61.2  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  31.25 
 
 
452 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  24.61 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.43 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>