More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1484 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  100 
 
 		 391 aa  803    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.01 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  43.59 
 
 		 395 aa  345  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.37 
 
 		 393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  41.65 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33 
 
 		 413 aa  199  7.999999999999999e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.2 
 
 		 433 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  26.7 
 
 		 419 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  26.34 
 
 		 421 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.23 
 
 		 411 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.47 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  25.97 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  25.79 
 
 		 435 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  25.58 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  26.74 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.96 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  25.06 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  25.23 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.74 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  25.59 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.93 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.84 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  25.97 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  24.67 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.49 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  26.2 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  25.4 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  27.99 
 
 		 374 aa  106  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  25.06 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  25.06 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  25.06 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.57 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  26.33 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  27.12 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  25.59 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  27.46 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.15 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  24.1 
 
 		 452 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.63 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  26.44 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  27.73 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.34 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  24.6 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  24.38 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.18 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  27.27 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1991  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.4 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  23.87 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  26.15 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 426 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3066  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.58 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.08 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  26.41 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.24 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  24.86 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  23.68 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02544  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.44 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0279642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  24.74 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  23.99 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03183  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.74 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  29.64 
 
 		 468 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.7 
 
 		 366 aa  96.3  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  24.32 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  27.59 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  27.37 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.56 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  25.2 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.8 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.56 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  23.96 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.37 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  24.12 
 
 		 462 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  24.31 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  28.89 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1523  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.65 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  25.78 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  24.08 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  24.74 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  27.1 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 383 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.47 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.49 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  27.03 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  25.52 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.06 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  0.131095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  25.48 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  25.69 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>