More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2619 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  890    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  62.59 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  61.41 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  61.56 
 
 		 440 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  63.53 
 
 		 440 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  59.53 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  59.39 
 
 		 438 aa  488  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  59.32 
 
 		 443 aa  491  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  60.32 
 
 		 442 aa  487  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  55.4 
 
 		 434 aa  485  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  57.08 
 
 		 442 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  55.4 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  57.18 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  59.29 
 
 		 442 aa  482  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  56.29 
 
 		 442 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  57.53 
 
 		 441 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  58 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  57.31 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  56.34 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  56.88 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  55.66 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  56.78 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  54.23 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  52.44 
 
 		 441 aa  448  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  54.03 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  55.84 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  54.25 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  50 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  54.21 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  54.21 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  54.21 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  54.25 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  52.07 
 
 		 448 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  51.73 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  52.81 
 
 		 450 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  55.17 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  50.47 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  49.43 
 
 		 451 aa  388  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  47.43 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  50.35 
 
 		 428 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  47.05 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  44.52 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  32.11 
 
 		 473 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  29.84 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  30.94 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  32.03 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  30.4 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.87 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.02 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  32.49 
 
 		 493 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  29.02 
 
 		 485 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  31.65 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  32.65 
 
 		 497 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  27.37 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  31.08 
 
 		 493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  32.13 
 
 		 491 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  29 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  30.05 
 
 		 549 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  31.54 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  30.48 
 
 		 507 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  30.48 
 
 		 507 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  28 
 
 		 457 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.22 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  28.51 
 
 		 494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  32.03 
 
 		 487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  25.58 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  30.41 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.56 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.16 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.54 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.11 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.74 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  28.42 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  27.23 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  26.64 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  25.88 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  27.37 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  27.84 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  29.22 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26.68 
 
 		 494 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  25.94 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.54 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  30.18 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.28 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  29.81 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  25.52 
 
 		 391 aa  93.6  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.47 
 
 		 374 aa  93.2  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  33.95 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.96 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 		 586 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  23.7 
 
 		 591 aa  87.8  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  35.84 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  26.04 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>