More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3615 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1021    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  35.1 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  32.83 
 
 		 477 aa  264  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  34.69 
 
 		 497 aa  256  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  33.05 
 
 		 483 aa  253  7e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  33 
 
 		 549 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  34.01 
 
 		 491 aa  246  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  33.33 
 
 		 493 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  32.65 
 
 		 493 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  32.65 
 
 		 493 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  32.72 
 
 		 487 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  33.64 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  32.57 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  31.08 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  28.72 
 
 		 489 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  31.61 
 
 		 507 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  31.61 
 
 		 507 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  29.72 
 
 		 508 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.43 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  27.53 
 
 		 582 aa  139  8.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  27.23 
 
 		 591 aa  136  8e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  26.84 
 
 		 469 aa  127  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  26.62 
 
 		 485 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  29.62 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  25.94 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  25.67 
 
 		 564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  23.86 
 
 		 573 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  28.33 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  29.27 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  29.26 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  28.05 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  26.97 
 
 		 478 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  27.37 
 
 		 587 aa  113  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  26.78 
 
 		 473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  25.58 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  28.09 
 
 		 440 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 		 660 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  26.36 
 
 		 448 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  30.03 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  27.64 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  27.64 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  27.57 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  27.4 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  27.64 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  27.64 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  23.52 
 
 		 468 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  28.39 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  26.68 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  32.7 
 
 		 602 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  27.42 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  27.13 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  26.17 
 
 		 462 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  25.4 
 
 		 450 aa  103  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  25.46 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  26.36 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  27.42 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  24.6 
 
 		 581 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  26.15 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  25.94 
 
 		 442 aa  97.8  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  27.14 
 
 		 429 aa  96.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  26.65 
 
 		 472 aa  96.7  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  27.95 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  26.13 
 
 		 449 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  27.01 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  26.26 
 
 		 442 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  24.62 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  25.32 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  26.91 
 
 		 443 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  26.3 
 
 		 441 aa  94  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  26.84 
 
 		 432 aa  93.6  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  26.77 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  23.35 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  24.37 
 
 		 402 aa  92.4  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  26.6 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  24.44 
 
 		 600 aa  89.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  26.72 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  23.62 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.02 
 
 		 388 aa  87.8  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  27.49 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  24.04 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.86 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.37 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  25.18 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.26 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2518  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.3 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00740773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  26.43 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.57 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.57 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  24.25 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.58 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  26.44 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.3 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.53 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.68 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.53 
 
 		 391 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.28 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  35.06 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>