More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0450 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  985    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  36.47 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  35.48 
 
 		 483 aa  303  5.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  35.28 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  35.98 
 
 		 497 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  35.73 
 
 		 487 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  32.7 
 
 		 493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  32.75 
 
 		 493 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  32.77 
 
 		 489 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 549 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  32.7 
 
 		 494 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  33.48 
 
 		 493 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  33.26 
 
 		 508 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  33.18 
 
 		 493 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  33.48 
 
 		 490 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  31.34 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  32.04 
 
 		 507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  32.04 
 
 		 507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  28.51 
 
 		 591 aa  180  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  27.56 
 
 		 573 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  27.23 
 
 		 587 aa  156  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  28.42 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  26.21 
 
 		 582 aa  150  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 		 660 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  26.67 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  25.71 
 
 		 437 aa  131  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  25.58 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  27.27 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  25.59 
 
 		 581 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  24.85 
 
 		 602 aa  124  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  26.29 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  25.38 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  23.75 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  26.84 
 
 		 435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  24.27 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  26.48 
 
 		 478 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  24.76 
 
 		 432 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  25.79 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  24.25 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  26.15 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  24.46 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  26.52 
 
 		 600 aa  115  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  26.39 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  24.34 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  26.05 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  27.03 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  24.04 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  26.25 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  25.86 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  26.65 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  26.23 
 
 		 468 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  27.15 
 
 		 446 aa  107  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  25.78 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  24.68 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  23.72 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  24.61 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  24.67 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  25.07 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  23.19 
 
 		 441 aa  103  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  26.18 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  25 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  23.85 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  24.18 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  23.31 
 
 		 442 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  23.51 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  24.16 
 
 		 485 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  24.87 
 
 		 439 aa  96.3  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  24.81 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  23.54 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  23.11 
 
 		 476 aa  93.6  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  23.5 
 
 		 439 aa  93.2  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  23.67 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  22.4 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  22.62 
 
 		 440 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  24.37 
 
 		 434 aa  90.1  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  24.21 
 
 		 444 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  24.21 
 
 		 444 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  24.21 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  25.89 
 
 		 374 aa  87.4  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  22.31 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  23.19 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0449  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.81 
 
 		 390 aa  76.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.408478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.23 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3116  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.49 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.210379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.45 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.85 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.06 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1128  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.57 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0048  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.62 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.56 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.37 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.28 
 
 		 391 aa  67  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2996  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.95 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.58 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  21.48 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.51 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.81 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  23.83 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>