More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  70.34 
 
 		 441 aa  642    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  77.73 
 
 		 438 aa  686    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  100 
 
 		 445 aa  897    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  74.37 
 
 		 442 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  68.37 
 
 		 434 aa  608  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  66.82 
 
 		 439 aa  601  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  67.21 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  65.6 
 
 		 446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  61.66 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  60.7 
 
 		 441 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  60.46 
 
 		 432 aa  514  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  58.77 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  62.56 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  59.77 
 
 		 462 aa  501  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  58.47 
 
 		 440 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  58.29 
 
 		 435 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  57.49 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  57.3 
 
 		 443 aa  491  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  58 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  58 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  56.91 
 
 		 437 aa  489  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  57.27 
 
 		 442 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  56.31 
 
 		 442 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  56.81 
 
 		 429 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  58.76 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  57.47 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  53.85 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  54.79 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  52.61 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  53.42 
 
 		 444 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  53.42 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  53.42 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  53.33 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  50.91 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  50 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  49.66 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  50.81 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  52.47 
 
 		 430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  48.26 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  51.4 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  44.05 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  47.75 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  32.01 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.16 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  33.42 
 
 		 473 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  30.37 
 
 		 485 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.65 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  28.7 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  30.21 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  30.26 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  29.87 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  30.91 
 
 		 497 aa  136  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  27.4 
 
 		 485 aa  129  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  30.36 
 
 		 472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  30.15 
 
 		 457 aa  124  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.43 
 
 		 508 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  28.75 
 
 		 493 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  28.75 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  26.97 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  29.41 
 
 		 419 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  26.85 
 
 		 476 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  28.54 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  27.3 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  29.38 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  27.18 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  26.41 
 
 		 549 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  24.81 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  27.41 
 
 		 507 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  27.41 
 
 		 507 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.21 
 
 		 433 aa  99.8  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.04 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  28.68 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  27.75 
 
 		 493 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.04 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26 
 
 		 388 aa  93.6  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  27.49 
 
 		 494 aa  93.2  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  24.63 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  24.82 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  26.06 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  24.1 
 
 		 591 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  27.93 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  23.92 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.13 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  26.59 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  23.02 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  23.04 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.54 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  24.65 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  24.63 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  25.07 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  22.9 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  33.66 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.02 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.82 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  27.99 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.29 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  23.1 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  23.08 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  24.26 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>