More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1037 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  100 
 
 		 497 aa  983    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  44.52 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  46.93 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  45.54 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  45.98 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  44.79 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  41.57 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  45.35 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  45.12 
 
 		 507 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  45.12 
 
 		 507 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  44.94 
 
 		 489 aa  355  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  44.56 
 
 		 493 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  38.56 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  41.26 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  42.3 
 
 		 440 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  35.4 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  32.72 
 
 		 494 aa  259  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  33.48 
 
 		 483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  33.84 
 
 		 465 aa  223  8e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 		 660 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  34.17 
 
 		 587 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  29.82 
 
 		 591 aa  210  4e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  29.31 
 
 		 573 aa  203  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  30 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 		 564 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  31.37 
 
 		 581 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  29.98 
 
 		 602 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  35.53 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  28.57 
 
 		 600 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  34.03 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  34.66 
 
 		 440 aa  161  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  33.42 
 
 		 434 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  30.56 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  33.67 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  31.46 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  31.9 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  31.9 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  33.07 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  31.9 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  31.38 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  32.97 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  33.25 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  34.37 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  32.19 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  30.36 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  33.02 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  33.33 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  31.22 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  31.68 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  33.02 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  32.65 
 
 		 444 aa  143  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  29.93 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  31.89 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  34.49 
 
 		 442 aa  141  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  32.57 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  32.52 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  36.68 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  31.78 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  32.6 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  30.16 
 
 		 434 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  27.81 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  32.24 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  32.89 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  29.85 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  31.72 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  31.55 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  32.84 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.18 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  32.8 
 
 		 443 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  30.38 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  29.67 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.91 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  28.13 
 
 		 476 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  32.88 
 
 		 468 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  29.82 
 
 		 494 aa  120  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  29.97 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  30.95 
 
 		 444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.18 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.62 
 
 		 388 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  28.68 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  28.45 
 
 		 434 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.55 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  28.68 
 
 		 374 aa  104  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.65 
 
 		 382 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.79 
 
 		 375 aa  96.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.42 
 
 		 393 aa  94.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  25.39 
 
 		 390 aa  91.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  22.22 
 
 		 485 aa  89.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.39 
 
 		 388 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.59 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.37 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.19 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.06 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.32 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>