More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01640 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  100 
 
 
660 aa  1356    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  48.16 
 
 
602 aa  502  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  39.05 
 
 
582 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  38.67 
 
 
587 aa  343  5e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  35.46 
 
 
573 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  35.44 
 
 
564 aa  330  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  34.44 
 
 
591 aa  323  6e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  34.77 
 
 
600 aa  298  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.262753 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  34.86 
 
 
581 aa  287  5e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  30.73 
 
 
497 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  27.2 
 
 
487 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  30.18 
 
 
489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  26.96 
 
 
493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.46 
 
 
491 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  28.66 
 
 
507 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  28.66 
 
 
507 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  29.74 
 
 
510 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  25.56 
 
 
493 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.98 
 
 
508 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  26.25 
 
 
493 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.81 
 
 
465 aa  163  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  28.02 
 
 
493 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  27.45 
 
 
549 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  28.19 
 
 
440 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  24.76 
 
 
477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  27.4 
 
 
490 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  24.6 
 
 
494 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  23.05 
 
 
483 aa  110  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  27.58 
 
 
467 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  25.36 
 
 
468 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  33.01 
 
 
433 aa  88.6  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  25.13 
 
 
434 aa  88.6  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.99 
 
 
388 aa  87.8  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  27.05 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  24.07 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  35.85 
 
 
444 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  25.33 
 
 
442 aa  84  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  27.88 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  28.84 
 
 
478 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  27.49 
 
 
457 aa  82  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  23.21 
 
 
462 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  27.3 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  26.13 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  33.16 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  28.35 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  28.62 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  26.37 
 
 
494 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  27.38 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  26.85 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.14 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  36.99 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  29.83 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  22.32 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  24.03 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  23.45 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  25.08 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  27.01 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  32.8 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  32.65 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  31.67 
 
 
450 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  31.61 
 
 
432 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  22.68 
 
 
430 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  37.67 
 
 
395 aa  72  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  42.42 
 
 
445 aa  72  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  31.75 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  31.91 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  33.97 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  30.53 
 
 
439 aa  70.1  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  37.84 
 
 
390 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  43.88 
 
 
442 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  27.22 
 
 
469 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.8 
 
 
381 aa  69.7  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  24.68 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  25.06 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  29.67 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.96 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  25.26 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  25.26 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  31.16 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  30.81 
 
 
443 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  29.52 
 
 
468 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  26.09 
 
 
411 aa  65.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.9 
 
 
388 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  40.4 
 
 
429 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  40.82 
 
 
442 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.64 
 
 
414 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  35.21 
 
 
439 aa  65.1  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  28.73 
 
 
441 aa  65.1  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  33.15 
 
 
468 aa  64.3  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0048  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 
380 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.16 
 
 
433 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  32.6 
 
 
451 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  28.43 
 
 
421 aa  62.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  25 
 
 
485 aa  63.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 
380 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1128  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 
380 aa  62  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.95 
 
 
388 aa  61.6  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  30.88 
 
 
419 aa  60.5  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  28.73 
 
 
407 aa  60.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  27.96 
 
 
409 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>