More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28659 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  100 
 
 		 600 aa  1229    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  45.32 
 
 		 582 aa  459  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  36.02 
 
 		 564 aa  332  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  36.51 
 
 		 587 aa  327  3e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  34.77 
 
 		 660 aa  317  6e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  36.04 
 
 		 581 aa  313  5.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  33.6 
 
 		 602 aa  307  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  34.82 
 
 		 573 aa  287  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  33.77 
 
 		 591 aa  286  5.999999999999999e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  28.2 
 
 		 497 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  30.4 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.37 
 
 		 487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  29.35 
 
 		 493 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  28.93 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  28.23 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  28.19 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.13 
 
 		 491 aa  156  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.4 
 
 		 549 aa  155  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  29.09 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  29.09 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  28.6 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  29.67 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  27.84 
 
 		 493 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  26.57 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  26.17 
 
 		 465 aa  124  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  23.78 
 
 		 440 aa  122  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  26.31 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  24.89 
 
 		 494 aa  104  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  24.89 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  27.05 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  23.9 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  25.06 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  23.63 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  22.65 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  27.03 
 
 		 433 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  23.68 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  24.41 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  27.3 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  26.79 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.74 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  31.63 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  26.84 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  31.29 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  32.43 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  29.19 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  24.48 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  30.27 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  32.07 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  32.07 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.23 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  32.07 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  25.23 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  32.43 
 
 		 406 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  23.53 
 
 		 452 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.4 
 
 		 395 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  24 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  29.73 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  24.61 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  25.44 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  27.57 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  38.2 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  24.13 
 
 		 432 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  29.19 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  31.89 
 
 		 406 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  29.69 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  29.73 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.81 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.81 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.09 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  28.93 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.66 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  31.61 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  22.79 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  25.63 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  35.64 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  24.64 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  35.79 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  35.79 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  35.79 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  22.91 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  35.79 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  35.79 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  31.35 
 
 		 406 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  38.82 
 
 		 427 aa  57  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  27.88 
 
 		 386 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  29.9 
 
 		 382 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  28.11 
 
 		 397 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.69 
 
 		 388 aa  56.6  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  29.44 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.03 
 
 		 393 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  29.23 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  23.51 
 
 		 448 aa  56.2  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  28.8 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  35.79 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 		 375 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  30.43 
 
 		 439 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.26 
 
 		 413 aa  56.2  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>