More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1434 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  100 
 
 		 438 aa  895    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  32.97 
 
 		 465 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  32.03 
 
 		 464 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  32.75 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  29.81 
 
 		 464 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  30.51 
 
 		 467 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  32.14 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  30.22 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  28.91 
 
 		 463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  30.42 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  30.74 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  30.84 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  29.23 
 
 		 469 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  28.48 
 
 		 465 aa  206  9e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  28.79 
 
 		 467 aa  202  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  27.83 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  27.68 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  28.76 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  28.95 
 
 		 468 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  28.76 
 
 		 468 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  29.26 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  28.51 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  28.54 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  28.73 
 
 		 468 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  28.48 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  28.92 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  28.63 
 
 		 481 aa  188  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  27.8 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  29.48 
 
 		 476 aa  187  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  30.22 
 
 		 444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  27.16 
 
 		 469 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  27.16 
 
 		 469 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  27.29 
 
 		 470 aa  180  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  26.92 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  25.55 
 
 		 469 aa  173  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  26.81 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  26.96 
 
 		 481 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  28.34 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  25.06 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  25.06 
 
 		 576 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  28.05 
 
 		 504 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  26.09 
 
 		 575 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  24.7 
 
 		 592 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.62 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  25.6 
 
 		 579 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  26.76 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.86 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  23.96 
 
 		 456 aa  127  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  26.18 
 
 		 534 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  23 
 
 		 579 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  26.1 
 
 		 508 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  22.76 
 
 		 576 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  23.59 
 
 		 585 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  22.74 
 
 		 579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  23.71 
 
 		 579 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  25.87 
 
 		 547 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  23.59 
 
 		 576 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  23.17 
 
 		 576 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  24.36 
 
 		 547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  24.4 
 
 		 533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  25.87 
 
 		 547 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  26.76 
 
 		 525 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  25 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  24.28 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  23.35 
 
 		 578 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  25.65 
 
 		 591 aa  86.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  24.32 
 
 		 374 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.2 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  33.53 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  29.14 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.54 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  31.71 
 
 		 549 aa  73.2  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  26.41 
 
 		 237 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  41.12 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  31.16 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  27.15 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.82 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  25.82 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.65 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.21 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  38.3 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  24.87 
 
 		 487 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  30.18 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  34.78 
 
 		 507 aa  67  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  34.78 
 
 		 507 aa  67  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  27.5 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.67 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  29.1 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  29.88 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  30.67 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  21.78 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  24.88 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.03 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.06 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.48 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  29.85 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  33.9 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  33.67 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  36.25 
 
 		 108 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  35.16 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>