More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0216 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  920    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  54.29 
 
 		 468 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  50.22 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  41.18 
 
 		 472 aa  292  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  40.63 
 
 		 476 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  36.25 
 
 		 469 aa  269  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  36.91 
 
 		 478 aa  266  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  36.99 
 
 		 494 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  37.12 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  28.97 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  30.36 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  29.45 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  29.82 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  29.45 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  29.28 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  31.36 
 
 		 442 aa  141  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  30.81 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  27.21 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  29.13 
 
 		 434 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  26.75 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  29.56 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  29.97 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  28.74 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  30.51 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  28.94 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  31.64 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  29.83 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  27.55 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  28.11 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  29.2 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  29.22 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  30.21 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  28.64 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  27.93 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  28.13 
 
 		 444 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  28.13 
 
 		 444 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  29.1 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  28.13 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  27.78 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  29.19 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  28.4 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  27.69 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  28.45 
 
 		 435 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  27.61 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  28.82 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.37 
 
 		 549 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  28.69 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  27.95 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.08 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  30.81 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  26.7 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  26.71 
 
 		 450 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  27.82 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  26.72 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  29.47 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  27.8 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  27.67 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.1 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  28.29 
 
 		 429 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  27.74 
 
 		 510 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  27.36 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  29.32 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  27.94 
 
 		 507 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  27.94 
 
 		 507 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  25.98 
 
 		 493 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  24.04 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  24.37 
 
 		 494 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  26.2 
 
 		 493 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  25.77 
 
 		 493 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.62 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  26.49 
 
 		 493 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  26.61 
 
 		 508 aa  98.2  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 660 aa  90.9  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  25.39 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  30.66 
 
 		 602 aa  84.3  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  26.28 
 
 		 582 aa  83.2  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  29.01 
 
 		 587 aa  82.8  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  29.89 
 
 		 564 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.1 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  27.51 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.15 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.91 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.05 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  30.41 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.91 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  23.56 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  26.59 
 
 		 591 aa  73.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.13 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  25.71 
 
 		 573 aa  69.7  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  33.13 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.54 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  28.16 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.18 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  34.18 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  34.18 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>