More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1670 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  955    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  49.77 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  51.39 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  37.08 
 
 		 472 aa  282  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  38.15 
 
 		 476 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  36.07 
 
 		 478 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  34.7 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  35.29 
 
 		 494 aa  226  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  30.59 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  30.1 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  30.69 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  29.23 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  32.14 
 
 		 497 aa  153  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  30 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  30.85 
 
 		 444 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  30.21 
 
 		 440 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  31.12 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  28.92 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  31.1 
 
 		 487 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  29.41 
 
 		 491 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  31.07 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  29.09 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  31.52 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  28.53 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  29.09 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  30.86 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  29.69 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  28.87 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  28.91 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.04 
 
 		 549 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  30.59 
 
 		 490 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  29.92 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.08 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  28.27 
 
 		 442 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  29.43 
 
 		 441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  27.29 
 
 		 462 aa  136  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  29.44 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  29.44 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  29.95 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  28.5 
 
 		 489 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  29.84 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  28.57 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  26.35 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  28.9 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  27.92 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  27.58 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  27.23 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  28.42 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  28.72 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  28.1 
 
 		 493 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  29.19 
 
 		 448 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  29.13 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.11 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  29.13 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  24.77 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  29.13 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.9 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  28.91 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  29.84 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  26.55 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  26.23 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26.39 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  28.54 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  28.27 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  26.97 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  28.21 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  26.7 
 
 		 483 aa  116  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  27.82 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  26.04 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  25.54 
 
 		 582 aa  111  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  25.5 
 
 		 477 aa  110  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  26.95 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  27.09 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  28.18 
 
 		 660 aa  100  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  28.34 
 
 		 587 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  29.87 
 
 		 602 aa  93.6  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 564 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  28.67 
 
 		 573 aa  87  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.35 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.35 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  24.32 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  27.9 
 
 		 591 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  23.9 
 
 		 600 aa  77  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.57 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.38 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  31.82 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.03 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.38 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  24.89 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  25.99 
 
 		 581 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.59 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  35.68 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  34.78 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  30.28 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  27.59 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.38 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.95 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  33.14 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>