More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34371 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  100 
 
 		 582 aa  1196    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  43.84 
 
 		 600 aa  437  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  39.05 
 
 		 660 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  36.32 
 
 		 581 aa  343  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  36.66 
 
 		 564 aa  343  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  36.27 
 
 		 602 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  34.21 
 
 		 591 aa  323  4e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  33.46 
 
 		 573 aa  322  9.000000000000001e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  37.17 
 
 		 587 aa  317  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  30 
 
 		 497 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  27.89 
 
 		 489 aa  197  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.66 
 
 		 491 aa  194  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  26.48 
 
 		 487 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  30.17 
 
 		 510 aa  193  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  29.34 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  28.51 
 
 		 507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  28.51 
 
 		 507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.32 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  27.94 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  27.85 
 
 		 493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  28.84 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  28.95 
 
 		 493 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  26.52 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  26.21 
 
 		 477 aa  150  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  24.34 
 
 		 440 aa  144  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  27.53 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  23.54 
 
 		 483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  26.12 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  25.3 
 
 		 467 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  27.97 
 
 		 468 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  25.69 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  24.42 
 
 		 469 aa  87  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  23.15 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  23.02 
 
 		 485 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  24.28 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  22.07 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  31.25 
 
 		 428 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  30.56 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  26.28 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  35.03 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  21.65 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  21.71 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  36.67 
 
 		 440 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  37.36 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  25.35 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  22.94 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  38.04 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  22.65 
 
 		 390 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  25.88 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  39.56 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  39.18 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  25.21 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  29.48 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  24.51 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  38.04 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.59 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  39.13 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  21.74 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  39.56 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  23.13 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  22.63 
 
 		 432 aa  67  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  28.96 
 
 		 441 aa  67  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  21.58 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  22.73 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  38.04 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  36.96 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  35.05 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  36.26 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  30.86 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  35.48 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  32.23 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  27.86 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  30.46 
 
 		 451 aa  63.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  28.19 
 
 		 468 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  22.52 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  26.88 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  36.08 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  22.84 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  39.76 
 
 		 446 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  35.05 
 
 		 442 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  21.88 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  24.03 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.73 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  30.06 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  35.16 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  35.16 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  35.16 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.07 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  30.6 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.83 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.2 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.65 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2451  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.81 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.684558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2507  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.81 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.82 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  28.87 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  29.72 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.25 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>