259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA02910 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  100 
 
 
573 aa  1181    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  67.67 
 
 
591 aa  798    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  36.83 
 
 
587 aa  343  4e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  35.46 
 
 
660 aa  341  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  33.46 
 
 
582 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  35.54 
 
 
564 aa  317  4e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  34.88 
 
 
602 aa  313  4.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  35.53 
 
 
581 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  34.82 
 
 
600 aa  272  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  30.86 
 
 
510 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  30.33 
 
 
507 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  30.33 
 
 
507 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  29.46 
 
 
493 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  30.8 
 
 
491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  30.29 
 
 
493 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  28.63 
 
 
493 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  30.66 
 
 
489 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  29.65 
 
 
487 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  30.65 
 
 
508 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  28.84 
 
 
493 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.45 
 
 
549 aa  204  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  29.31 
 
 
497 aa  204  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  29.58 
 
 
490 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  26.38 
 
 
440 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  27.56 
 
 
477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.35 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  26.51 
 
 
483 aa  136  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  23.86 
 
 
494 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  22.54 
 
 
434 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  23.13 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  23.04 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  28.67 
 
 
467 aa  84  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  27.03 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  22.98 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  23.75 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  23.4 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  22.14 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  26.89 
 
 
494 aa  77  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  25.17 
 
 
446 aa  77  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  21.93 
 
 
437 aa  76.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  21.9 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  24.04 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  27.59 
 
 
472 aa  76.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  26.13 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  23.82 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  23.64 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  22.69 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  23.67 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  22.14 
 
 
428 aa  73.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  22.8 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  21.85 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  22.93 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  21.39 
 
 
433 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  24.51 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  24.37 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  24.31 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  23.41 
 
 
444 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  22.11 
 
 
440 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  22.54 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  23.15 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  22.46 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  22.33 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  22.99 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  23.88 
 
 
473 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  24.16 
 
 
440 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  26.07 
 
 
457 aa  65.1  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  20.71 
 
 
468 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  20.29 
 
 
390 aa  63.9  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  22.89 
 
 
442 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  23.29 
 
 
450 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  23.17 
 
 
444 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  23.7 
 
 
485 aa  62.4  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.07 
 
 
375 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.43 
 
 
375 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  22.76 
 
 
441 aa  60.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.82 
 
 
407 aa  60.8  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  20.72 
 
 
439 aa  60.5  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  22.93 
 
 
444 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  22.93 
 
 
444 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.5 
 
 
375 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.91 
 
 
377 aa  60.1  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.93 
 
 
377 aa  60.1  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.89 
 
 
391 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  21.96 
 
 
451 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1734  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.87 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  22.22 
 
 
430 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  19.32 
 
 
393 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  22.81 
 
 
434 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.33 
 
 
407 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.88 
 
 
386 aa  58.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1810  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 
406 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.834903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.41 
 
 
375 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27 
 
 
375 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27 
 
 
375 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  29.63 
 
 
374 aa  57.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.53 
 
 
375 aa  57.4  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.37 
 
 
391 aa  57.4  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.1 
 
 
385 aa  56.6  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.89 
 
 
375 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23 
 
 
382 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>