210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04480 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  100 
 
 
587 aa  1213    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  37.24 
 
 
591 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  37.21 
 
 
573 aa  352  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  38.91 
 
 
660 aa  350  3e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  37.89 
 
 
564 aa  334  3e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  37.58 
 
 
582 aa  323  4e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  36.96 
 
 
602 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  36.68 
 
 
600 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.262753 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  33.96 
 
 
581 aa  293  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  32.08 
 
 
487 aa  230  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  34.17 
 
 
497 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  34.29 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  34.29 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  33.4 
 
 
510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  30.91 
 
 
490 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  31.19 
 
 
491 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.75 
 
 
493 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  30.61 
 
 
493 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  31.24 
 
 
493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  32.35 
 
 
493 aa  180  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  28.96 
 
 
489 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  28.37 
 
 
549 aa  173  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  28.07 
 
 
483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  33.04 
 
 
508 aa  164  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  27.23 
 
 
477 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  26.71 
 
 
440 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  31.07 
 
 
465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  27.16 
 
 
494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  26.63 
 
 
428 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  30.07 
 
 
472 aa  95.5  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  28.67 
 
 
467 aa  94  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  30.37 
 
 
468 aa  93.6  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  26.11 
 
 
478 aa  90.9  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  25.47 
 
 
434 aa  87.4  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  28.47 
 
 
485 aa  87.4  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  25.19 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  26.85 
 
 
476 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  25.23 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  29.19 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  27.72 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  25.37 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  29.07 
 
 
469 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  26.45 
 
 
434 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  24.54 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  25.08 
 
 
434 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  25.74 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  24.63 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  27.84 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  24.49 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  25.24 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  27.17 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  26.34 
 
 
441 aa  77  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  27.18 
 
 
446 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  23.69 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  24.09 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  23.69 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  24.5 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  25.42 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  27.4 
 
 
494 aa  74.3  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  25.62 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  23.67 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  34.12 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  24.88 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  25.36 
 
 
440 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  27.08 
 
 
440 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  26.88 
 
 
439 aa  72  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  25.84 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  26.76 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.41 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  28.65 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  24.28 
 
 
442 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  24.74 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  25.89 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  23.72 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  24.81 
 
 
462 aa  68.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  30 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  38.3 
 
 
444 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  23.44 
 
 
438 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  30.81 
 
 
470 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  26.26 
 
 
435 aa  64.3  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  25.45 
 
 
442 aa  64.3  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  33.33 
 
 
391 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 
388 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  26.17 
 
 
465 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 
407 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 
407 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  23.1 
 
 
451 aa  60.8  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.33 
 
 
434 aa  60.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  23.96 
 
 
448 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  35.34 
 
 
422 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  30.77 
 
 
437 aa  58.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  34.58 
 
 
450 aa  58.5  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  28.21 
 
 
453 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.15 
 
 
402 aa  57  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  28.64 
 
 
409 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  34.15 
 
 
473 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.64 
 
 
381 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.14 
 
 
382 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  42.67 
 
 
476 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.77 
 
 
377 aa  55.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>