More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6284 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  100 
 
 		 489 aa  971    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  42.62 
 
 		 493 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  41.8 
 
 		 493 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  44.47 
 
 		 493 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  45.66 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  43.21 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  40.22 
 
 		 549 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  42.89 
 
 		 493 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  42.63 
 
 		 510 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  42.11 
 
 		 507 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  42.11 
 
 		 507 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  37.37 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  33.73 
 
 		 508 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  37.33 
 
 		 490 aa  276  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  34.25 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  38.1 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  28.72 
 
 		 494 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  31.26 
 
 		 591 aa  223  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  31.43 
 
 		 573 aa  222  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  30.93 
 
 		 483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  32.66 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 		 660 aa  206  6e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  28.03 
 
 		 582 aa  203  5e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  29.02 
 
 		 587 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  32.14 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  26.51 
 
 		 602 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 564 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  32.03 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  27.88 
 
 		 600 aa  148  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  30.53 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  29.17 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  31.71 
 
 		 437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  30.97 
 
 		 443 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  30.07 
 
 		 440 aa  140  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.01 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  31.78 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  30.73 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  30.88 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  29.61 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  30.66 
 
 		 485 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  30.24 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  30.05 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  29.69 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  29.11 
 
 		 443 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  29.7 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  30.73 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  30.83 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  30.19 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  30.59 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  28.57 
 
 		 494 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  29.19 
 
 		 452 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  31.06 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  27.86 
 
 		 467 aa  130  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  32.04 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  27.05 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  32.82 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  29.71 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  29.67 
 
 		 462 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  32.55 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  31.83 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  28.73 
 
 		 441 aa  127  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  31.83 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  31.05 
 
 		 444 aa  127  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  30.69 
 
 		 442 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  31.77 
 
 		 440 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  27.57 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  32.4 
 
 		 428 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  26.02 
 
 		 441 aa  121  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  28.03 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  27.57 
 
 		 434 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  27.68 
 
 		 434 aa  117  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  29.68 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  30.27 
 
 		 457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  27.04 
 
 		 429 aa  114  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  29.07 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.75 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  29.37 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  28.49 
 
 		 468 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.3 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  27.83 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  24.65 
 
 		 473 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  30.94 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  26.81 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.74 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.87 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  23.08 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  25.34 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0449  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.89 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.408478 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  40.35 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.75 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.84 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  46.05 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.57 
 
 		 407 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.17 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  35.21 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  39.57 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.41 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  26.67 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>