More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1820 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  999    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  41.7 
 
 		 469 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  44.68 
 
 		 485 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  40 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  40.17 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  41.12 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  36.89 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  37.17 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  35.29 
 
 		 467 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  29.1 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  32.35 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  33.03 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  31.29 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  32.52 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  29.98 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  29.44 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  31.77 
 
 		 438 aa  160  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  30.8 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  29.56 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  29.09 
 
 		 485 aa  158  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  30.07 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  30.23 
 
 		 442 aa  157  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  30.25 
 
 		 442 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  30.56 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  32.44 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  28.77 
 
 		 449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  28.7 
 
 		 451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  28.85 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  30.13 
 
 		 448 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  30.51 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  28.79 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  28.79 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  29.05 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  31.17 
 
 		 441 aa  148  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  32.25 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  30.92 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  28.86 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  30.56 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  27.84 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  29.88 
 
 		 462 aa  143  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  29.79 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  29.15 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.21 
 
 		 445 aa  140  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  32.65 
 
 		 435 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  30.07 
 
 		 434 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  31.69 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  28.05 
 
 		 508 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  28.51 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  29.06 
 
 		 489 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  28.05 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.31 
 
 		 491 aa  127  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  27.2 
 
 		 493 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  28.19 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  31.15 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  29.09 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  28.61 
 
 		 493 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  29.82 
 
 		 497 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  27.61 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  30.95 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  29.79 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  29.92 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  28.31 
 
 		 549 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  25.58 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  30.23 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  25.69 
 
 		 487 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  25.37 
 
 		 483 aa  107  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  29.46 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  27.13 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  27.13 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  27.39 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  26.72 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  23.2 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.1 
 
 		 477 aa  90.1  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  26.73 
 
 		 465 aa  89  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  27.68 
 
 		 591 aa  87  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  35.15 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  30.58 
 
 		 411 aa  83.2  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.5 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 		 660 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.75 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  26.89 
 
 		 573 aa  77  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  28.44 
 
 		 451 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  30.84 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  31.3 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  29.19 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.36 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.47 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  26.71 
 
 		 587 aa  73.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.37 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.09 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.72 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.82 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.5 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  28.32 
 
 		 602 aa  70.1  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  23.21 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.97 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.97 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.18 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.92 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>