174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI02790 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  67.67 
 
 		 573 aa  798    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  100 
 
 		 591 aa  1218    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  37.04 
 
 		 587 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  34.21 
 
 		 582 aa  324  3e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 		 660 aa  323  5e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  35.23 
 
 		 564 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  34.2 
 
 		 602 aa  289  8e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  35.48 
 
 		 581 aa  286  7e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  33.77 
 
 		 600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  32.89 
 
 		 507 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  32.89 
 
 		 507 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  32.03 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  32.78 
 
 		 510 aa  224  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  32.64 
 
 		 491 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  32.56 
 
 		 508 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  31.29 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  31.05 
 
 		 493 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  30.95 
 
 		 489 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  29.82 
 
 		 497 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.57 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.51 
 
 		 487 aa  206  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  32.73 
 
 		 493 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  30.17 
 
 		 490 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  28.75 
 
 		 440 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  28.51 
 
 		 477 aa  181  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  29.31 
 
 		 465 aa  154  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  27.57 
 
 		 483 aa  145  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  27.23 
 
 		 494 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  26.13 
 
 		 472 aa  90.9  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  26.43 
 
 		 434 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  24.07 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  25.17 
 
 		 443 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  23.7 
 
 		 444 aa  87.8  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  27.68 
 
 		 494 aa  87.4  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  25.78 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  22.43 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  25.59 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  25.92 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  26.63 
 
 		 439 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  24.1 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  28.37 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  23.11 
 
 		 438 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  25.79 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  22.39 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  23.19 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  28.52 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  24.22 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  23.58 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  25.24 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  25.19 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  25.41 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  23.26 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  27.94 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  27.9 
 
 		 467 aa  76.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  25.83 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  25.63 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  25.78 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  23.74 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  25.78 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  25.78 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  22.06 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  22.78 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  28.88 
 
 		 434 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  26.12 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  26.59 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  22.06 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  22.57 
 
 		 442 aa  70.1  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  22.97 
 
 		 448 aa  70.1  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  20.85 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  22.54 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  22.19 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  29.34 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  24.82 
 
 		 430 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  24.74 
 
 		 451 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  21.58 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  21.33 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  21.71 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  21.6 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  29.24 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  21.86 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.43 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.39 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.96 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  21.17 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.96 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  20.99 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.95 
 
 		 404 aa  55.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.37 
 
 		 426 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  29.85 
 
 		 374 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  23.13 
 
 		 442 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.71 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  28.21 
 
 		 444 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  19.38 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  27.67 
 
 		 421 aa  51.6  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1130  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.71 
 
 		 383 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.98 
 
 		 382 aa  50.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.11 
 
 		 383 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  0.131095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.6 
 
 		 377 aa  50.8  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  21.73 
 
 		 395 aa  50.8  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4199  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.11 
 
 		 383 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0319412  normal  0.906058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>