More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1544 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  915    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  37.22 
 
 		 464 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  35.2 
 
 		 450 aa  269  8.999999999999999e-71  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  34.35 
 
 		 449 aa  266  7e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  35.53 
 
 		 470 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  35.75 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  35.7 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  33.63 
 
 		 464 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  35.43 
 
 		 469 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.18 
 
 		 457 aa  236  8e-61  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  35.44 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  35.44 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  35.21 
 
 		 468 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  34.99 
 
 		 468 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  32.96 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  34.93 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  35.16 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  34.54 
 
 		 468 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  34.02 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  30.99 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  30.99 
 
 		 465 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  33.64 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  34.05 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  34.05 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  34.72 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  36.9 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  33.33 
 
 		 471 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  33.18 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  32.03 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  32.2 
 
 		 469 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  32.97 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  33.96 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  31.82 
 
 		 463 aa  193  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  30.22 
 
 		 438 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  31.43 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  31.12 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  31.39 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  30.5 
 
 		 476 aa  162  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.73 
 
 		 345 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  28.73 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  28.98 
 
 		 579 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  25.26 
 
 		 576 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  27.94 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  24.44 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  24.44 
 
 		 585 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  26.42 
 
 		 534 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  24.54 
 
 		 575 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  24.69 
 
 		 576 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  26.75 
 
 		 592 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  25.58 
 
 		 508 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  26.49 
 
 		 578 aa  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  25.36 
 
 		 576 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  24.49 
 
 		 576 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  24.79 
 
 		 579 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  25.05 
 
 		 579 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  25.77 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  26.12 
 
 		 504 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  27.91 
 
 		 525 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  24.41 
 
 		 579 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  25.11 
 
 		 547 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  25.94 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  25.17 
 
 		 547 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  25 
 
 		 533 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  24.51 
 
 		 533 aa  93.2  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  25.22 
 
 		 533 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.17 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  25.13 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  37.96 
 
 		 108 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  27.23 
 
 		 280 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  28.19 
 
 		 591 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  26.27 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  30.32 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  31.11 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.44 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.86 
 
 		 382 aa  67  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  35.88 
 
 		 396 aa  67  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  33.59 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  33.75 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  30.12 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  23.13 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.11 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.04 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1991  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.81 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.75 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.78 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.75 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.07 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.19 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  40.26 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1814  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.71 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93447  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  29.14 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1765  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.87 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.803337  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  32.47 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  33.77 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  28.57 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  33.12 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.33 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>