More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1231 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  95.7 
 
 		 465 aa  893    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  100 
 
 		 465 aa  929    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  56.99 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  45.89 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  42.61 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  42.3 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  41.81 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  41.38 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  41.59 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  41.38 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  40.95 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  41.59 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  41.38 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  41.16 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  41.18 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  43.68 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  39.52 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  39.96 
 
 		 464 aa  337  3.9999999999999995e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  37.5 
 
 		 468 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  38.88 
 
 		 465 aa  310  5e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  37.12 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  37.15 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  35.37 
 
 		 467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  35.6 
 
 		 468 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  35.12 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  33.4 
 
 		 469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  33.4 
 
 		 469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  34.26 
 
 		 471 aa  263  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  32.69 
 
 		 473 aa  263  6e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.12 
 
 		 345 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  32.97 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  36.77 
 
 		 449 aa  239  5e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  32.36 
 
 		 473 aa  237  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  30.99 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  33.9 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  30.06 
 
 		 476 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  30.19 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  30.34 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  30.23 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  28.51 
 
 		 579 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  31.12 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.79 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  27.25 
 
 		 576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  27.04 
 
 		 575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  27.41 
 
 		 576 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  28.47 
 
 		 592 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  27.78 
 
 		 504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  28.11 
 
 		 579 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  25.86 
 
 		 576 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  28.11 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  26.73 
 
 		 576 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  27.64 
 
 		 579 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  25.58 
 
 		 576 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  25.35 
 
 		 585 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  26.39 
 
 		 578 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  27.59 
 
 		 533 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  27.07 
 
 		 508 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  30.59 
 
 		 525 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  26.4 
 
 		 534 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  26.82 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  26.97 
 
 		 533 aa  150  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  23.39 
 
 		 591 aa  146  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  26.64 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  26.34 
 
 		 547 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  25.9 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  23.5 
 
 		 456 aa  123  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  40.74 
 
 		 108 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  28.76 
 
 		 237 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  23.35 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.82 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.81 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  23.18 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  32.41 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.29 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  34.51 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  27.88 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  21.61 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  24.65 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  30.51 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.95 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  24.65 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  25.16 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.67 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  24.21 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  23.37 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.88 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.86 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  22.11 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  31.03 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.67 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.91 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.89 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.11 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  27.5 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  26.95 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  24.15 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 		 398 aa  67  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.39 
 
 		 390 aa  67  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  27.88 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  26.23 
 
 		 280 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>