More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0439 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  100 
 
 		 465 aa  949    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  45.73 
 
 		 468 aa  428  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  44.73 
 
 		 472 aa  395  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  44.4 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  43.81 
 
 		 468 aa  385  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  41.79 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  43.25 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  37.23 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  39.03 
 
 		 470 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  40.34 
 
 		 469 aa  346  6e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  40.34 
 
 		 469 aa  346  6e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  38.71 
 
 		 469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  38.03 
 
 		 468 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  38.03 
 
 		 468 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  37.61 
 
 		 468 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  37.82 
 
 		 468 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  37.61 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  37.61 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  37.18 
 
 		 468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  37.18 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  36.19 
 
 		 467 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  38.08 
 
 		 476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  37.12 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  39.13 
 
 		 464 aa  293  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  35.67 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  37.34 
 
 		 465 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  38.46 
 
 		 470 aa  283  6.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  36.32 
 
 		 464 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  36.2 
 
 		 465 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  34.77 
 
 		 464 aa  256  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  36.8 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.21 
 
 		 345 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  32.97 
 
 		 481 aa  226  8e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  32.51 
 
 		 473 aa  217  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  30.59 
 
 		 481 aa  206  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  28.48 
 
 		 438 aa  206  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  32.97 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  30.29 
 
 		 579 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  31.06 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  28.83 
 
 		 576 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  31.01 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  28.63 
 
 		 576 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  28.6 
 
 		 576 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  26.95 
 
 		 592 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  28.24 
 
 		 576 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  30.43 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  27.82 
 
 		 585 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  27.25 
 
 		 504 aa  163  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  27.78 
 
 		 575 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  29.08 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  27.29 
 
 		 576 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.24 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  29.69 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  28.9 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  28.48 
 
 		 579 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  29.25 
 
 		 525 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  26.75 
 
 		 578 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  27.79 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  25.93 
 
 		 591 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  27.03 
 
 		 547 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  26.79 
 
 		 547 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  27.12 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  27.4 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  27.03 
 
 		 547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  27.36 
 
 		 533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  24.69 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  43.52 
 
 		 108 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  25.37 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 426 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  23.41 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  31.41 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  25.79 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  25.56 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  35.04 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  33.33 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  31.21 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  25.33 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  23.77 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  30.77 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  21.6 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  34.04 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.91 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.64 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.97 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  31.21 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  27.44 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  31.1 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.29 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  30 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  28.7 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  33.78 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  23.63 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.1 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  28.05 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  25.83 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  37.97 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  27.67 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  30.47 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  32.21 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.86 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>