More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1046 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  100 
 
 		 464 aa  945    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  64.58 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  39.96 
 
 		 465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  39.52 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  38.13 
 
 		 464 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  38.61 
 
 		 468 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  38.65 
 
 		 464 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  38.39 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  37.74 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  36.31 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  35.71 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  38.39 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  37.74 
 
 		 468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  37.74 
 
 		 468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  37.74 
 
 		 468 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  37.74 
 
 		 468 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  36.54 
 
 		 467 aa  277  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  36.02 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  36.34 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  36.21 
 
 		 468 aa  263  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  34.77 
 
 		 465 aa  256  6e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  36.02 
 
 		 472 aa  253  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  33.84 
 
 		 473 aa  252  8.000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  34.13 
 
 		 471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  34.19 
 
 		 467 aa  243  5e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  32.48 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  32.48 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  33.91 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  32.48 
 
 		 469 aa  237  4e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  32.96 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  34 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  32.69 
 
 		 450 aa  218  1e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  30.42 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  30.8 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  30.98 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  32.07 
 
 		 481 aa  210  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  31.57 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.35 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  29.87 
 
 		 476 aa  179  9e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.54 
 
 		 457 aa  169  7e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  26 
 
 		 579 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  28.09 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  25.11 
 
 		 576 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  25.44 
 
 		 585 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  25.82 
 
 		 576 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  25.32 
 
 		 576 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  25.6 
 
 		 576 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  24.84 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  25.88 
 
 		 579 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  25.17 
 
 		 575 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  25.81 
 
 		 576 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  26.32 
 
 		 504 aa  146  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  25.62 
 
 		 592 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  23.11 
 
 		 579 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  24.54 
 
 		 591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  25.94 
 
 		 534 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  25.67 
 
 		 578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  26.59 
 
 		 525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  23.43 
 
 		 508 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  24.8 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  26.07 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  24.59 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  24.59 
 
 		 547 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  25.77 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  26.07 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  25.56 
 
 		 533 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  32.59 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  29.26 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  42.39 
 
 		 108 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  29.09 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  29.09 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  26.97 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  26.67 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  36.13 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  35.25 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.43 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  33.91 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  34.23 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  23.81 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  35.11 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  26.48 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  34.45 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.14 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  27.93 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  37.86 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  31.85 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  25.31 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  32.07 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  41.11 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3179  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.26 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.87 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1862  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.75 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000241136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  26.9 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  30.59 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  39.76 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  28.12 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  26.21 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.87 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  29.88 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>