126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0609 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  100 
 
 		 456 aa  926    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  28.26 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  28.35 
 
 		 484 aa  149  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  25.81 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  25.97 
 
 		 468 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  25.32 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  25.38 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  25.16 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  28.45 
 
 		 481 aa  141  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  25.92 
 
 		 468 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  25.16 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  25.6 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  25.7 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  25.72 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  26.37 
 
 		 481 aa  134  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  25.8 
 
 		 467 aa  133  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  24.4 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.22 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  23.41 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  24.01 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  23.96 
 
 		 438 aa  127  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  25.64 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  26.27 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  23.5 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  26.14 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  26.14 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  24.84 
 
 		 468 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  25.79 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  24.69 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  22.39 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  26.25 
 
 		 592 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  23.81 
 
 		 472 aa  114  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  25.18 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  25.42 
 
 		 575 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  25.77 
 
 		 464 aa  109  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  25.6 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  24.76 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  25.3 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  25.3 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.53 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  25.32 
 
 		 579 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  26.34 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  25.94 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  24.42 
 
 		 576 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  23.72 
 
 		 449 aa  97.8  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  24.21 
 
 		 576 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  24.11 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  24.52 
 
 		 578 aa  94.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  24.16 
 
 		 525 aa  94  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  24.15 
 
 		 534 aa  87  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  25.13 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  25.38 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  23.74 
 
 		 591 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  22.39 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  25.38 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  25.48 
 
 		 576 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  26.32 
 
 		 579 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  23.12 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  21.38 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  23.24 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  25.94 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  24.25 
 
 		 585 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  19.35 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  24.81 
 
 		 579 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  22.22 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  22.11 
 
 		 547 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  36.94 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  30.92 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  37.21 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  34.38 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  32.43 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  32.17 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  32.17 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  31.9 
 
 		 463 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2019  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 		 377 aa  50.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.9 
 
 		 388 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  31.82 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  26.67 
 
 		 280 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  31.25 
 
 		 462 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  32.61 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3620  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.45 
 
 		 377 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  29.63 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  35.06 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  31.25 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  26.47 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  32.91 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.17 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  34.25 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  29.33 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0581  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.66 
 
 		 375 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680439  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  29.87 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  31 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  29.87 
 
 		 415 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  32.71 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3697  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.1 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  34.95 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  32.91 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  27.75 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  43.14 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>