299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1208 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  62.61 
 
 		 575 aa  721    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1198    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  61.75 
 
 		 592 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  63.98 
 
 		 576 aa  733    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  65.32 
 
 		 579 aa  731    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  63.29 
 
 		 576 aa  716    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  38.26 
 
 		 576 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  39.2 
 
 		 579 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  38.31 
 
 		 579 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  37.94 
 
 		 579 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  36.51 
 
 		 576 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  36.24 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  35.73 
 
 		 576 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  29.78 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  31.71 
 
 		 533 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  31.76 
 
 		 533 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  32.53 
 
 		 534 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  33.2 
 
 		 547 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  31.57 
 
 		 533 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  33.01 
 
 		 547 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  31.12 
 
 		 508 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  30.52 
 
 		 578 aa  231  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  32.04 
 
 		 547 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  33.4 
 
 		 525 aa  226  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  27.11 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  26.77 
 
 		 464 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  26.75 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  25 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  24.05 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  27.9 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  28.43 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  26.51 
 
 		 467 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  25.82 
 
 		 472 aa  153  8.999999999999999e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  26.42 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  25.31 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  28.75 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  25.6 
 
 		 467 aa  146  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  27.87 
 
 		 468 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  30.17 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  29.17 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  29.02 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  26.04 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  27.8 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  27.63 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  28.78 
 
 		 468 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  29.51 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  25.15 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  24.49 
 
 		 438 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  22.56 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  25.2 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  23.79 
 
 		 465 aa  130  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  37.17 
 
 		 237 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  25.33 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  25.48 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  24.36 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  24.44 
 
 		 476 aa  120  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  25.42 
 
 		 484 aa  115  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.85 
 
 		 345 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  35.48 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  25.45 
 
 		 481 aa  107  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  25.65 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  23.9 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  24.35 
 
 		 456 aa  100  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.2 
 
 		 457 aa  100  1e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  24.24 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  23.08 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  23.08 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  23.83 
 
 		 469 aa  98.2  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.17 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  27.68 
 
 		 474 aa  62  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  34.21 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.21 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  31.8 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.84 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  28.14 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  33.85 
 
 		 412 aa  57  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.09 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  43.59 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  32.58 
 
 		 376 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  31.48 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1489  peptidase M20  37.35 
 
 		 432 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0188879  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  37.8 
 
 		 403 aa  54.7  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  43.04 
 
 		 455 aa  54.3  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3712  putative acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases  34.11 
 
 		 433 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.64 
 
 		 399 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  40.26 
 
 		 424 aa  53.9  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  42.11 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  45.45 
 
 		 387 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  32.61 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  31.65 
 
 		 380 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6159  peptidase M20  30 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.757625  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  45.45 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29911  predicted protein  51.92 
 
 		 445 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0349398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  34.38 
 
 		 422 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  33.93 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  28.44 
 
 		 459 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  44.16 
 
 		 387 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  41.77 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.24 
 
 		 442 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>