91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1363 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1045    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  50.9 
 
 		 508 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  49.51 
 
 		 533 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  49.06 
 
 		 533 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  49.7 
 
 		 547 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  49.9 
 
 		 547 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  49.32 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  49.05 
 
 		 534 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  49.49 
 
 		 547 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  48.41 
 
 		 578 aa  495  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  44.6 
 
 		 525 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  52.97 
 
 		 237 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  31.58 
 
 		 576 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  31.16 
 
 		 576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  54.63 
 
 		 280 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  31.57 
 
 		 576 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  30.74 
 
 		 579 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  31.16 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  30.75 
 
 		 585 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  30.96 
 
 		 576 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  29.68 
 
 		 575 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  29.78 
 
 		 591 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  30.53 
 
 		 592 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  31.82 
 
 		 579 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  31.2 
 
 		 579 aa  220  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  30.36 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  30.34 
 
 		 464 aa  192  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  29.21 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  27.78 
 
 		 465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  30 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  28.68 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  29.18 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  27.03 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  27.25 
 
 		 465 aa  163  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  27.5 
 
 		 463 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  27.02 
 
 		 467 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  30.53 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  29.41 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  30.53 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  30.29 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  29.81 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  26.89 
 
 		 469 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  27.67 
 
 		 473 aa  156  7e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  30.29 
 
 		 468 aa  156  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  30.29 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  30.05 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  30.05 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  28.05 
 
 		 438 aa  151  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  26.37 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  26.77 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  26.32 
 
 		 464 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  28.47 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  26.2 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  26.2 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  26.7 
 
 		 476 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  29.06 
 
 		 449 aa  136  8e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  28.48 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  27.99 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.1 
 
 		 457 aa  128  3e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  25.1 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  26.35 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  26.83 
 
 		 473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  22.32 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.08 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  26.12 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  25.94 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  23.59 
 
 		 484 aa  96.7  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  19.35 
 
 		 456 aa  73.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0372  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 		 514 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  25.31 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  29.61 
 
 		 535 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  28.1 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  34 
 
 		 407 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  33.33 
 
 		 512 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  38.03 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.94 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  28.47 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.7 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  36 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  32.29 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  23.5 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  26.92 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  36 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  34.94 
 
 		 108 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.97 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  25.14 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.32 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  36.49 
 
 		 457 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  36.49 
 
 		 470 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  26.62 
 
 		 407 aa  43.5  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  27.64 
 
 		 458 aa  43.5  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>