More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4890 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  64.29 
 
 		 591 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  71.25 
 
 		 575 aa  837    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  73.91 
 
 		 576 aa  855    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  73.74 
 
 		 576 aa  874    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  72.5 
 
 		 592 aa  818    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1180    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  40.92 
 
 		 579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  40.07 
 
 		 579 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  41.14 
 
 		 576 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  40.07 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  39.79 
 
 		 576 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  39.83 
 
 		 576 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  39.55 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  31.65 
 
 		 578 aa  249  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  32.78 
 
 		 534 aa  243  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  30.43 
 
 		 508 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  30.74 
 
 		 504 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  33.87 
 
 		 525 aa  230  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  30.65 
 
 		 533 aa  220  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  31.2 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  31.31 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  30.49 
 
 		 533 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  30.55 
 
 		 533 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  30.86 
 
 		 547 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  28.48 
 
 		 464 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  28.57 
 
 		 465 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  30.29 
 
 		 465 aa  193  8e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  28.51 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  28.95 
 
 		 468 aa  190  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  27.84 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  29.36 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  28.17 
 
 		 468 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  28.21 
 
 		 468 aa  173  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  26.57 
 
 		 467 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  28.82 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  28.48 
 
 		 468 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  27.03 
 
 		 464 aa  171  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  28.6 
 
 		 468 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  28.27 
 
 		 468 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  29.65 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  28.69 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  28.97 
 
 		 468 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  28.39 
 
 		 468 aa  166  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  28.66 
 
 		 470 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  27.45 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  26 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  28.57 
 
 		 472 aa  163  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  26.78 
 
 		 465 aa  160  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  26.23 
 
 		 463 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  26.95 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  25.36 
 
 		 473 aa  145  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  27.61 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  25.48 
 
 		 438 aa  139  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  26.28 
 
 		 481 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  25.64 
 
 		 481 aa  133  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  36.7 
 
 		 237 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  27.91 
 
 		 473 aa  131  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  27.45 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  24.68 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  28.98 
 
 		 444 aa  126  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.11 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  25.49 
 
 		 469 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  25.49 
 
 		 469 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  25.62 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  25.54 
 
 		 450 aa  106  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  25.32 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.25 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  30.57 
 
 		 280 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.19 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  30.48 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  29.19 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  31.46 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  32.84 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  30.77 
 
 		 404 aa  62  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  35.16 
 
 		 368 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6159  peptidase M20  29.87 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.757625  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  34.69 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  32.62 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.44 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  30.95 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  33.06 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  32.59 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  32.59 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1489  peptidase M20  37.84 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0188879  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  29.41 
 
 		 433 aa  57  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  34.62 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  32.21 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.3 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  33.96 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  44.16 
 
 		 460 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.64 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  31.06 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.9 
 
 		 411 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  31.11 
 
 		 480 aa  55.1  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  40.62 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0233  peptidase M20  35.24 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  32.33 
 
 		 376 aa  54.7  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  35.21 
 
 		 419 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  39.58 
 
 		 404 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>