294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1310 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  100 
 
 		 469 aa  969    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  82.52 
 
 		 469 aa  828    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  82.52 
 
 		 469 aa  828    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  44.21 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  44.09 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  43.66 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  44.09 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  43.66 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  43.44 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  43.23 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  43.44 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  43.01 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  43.01 
 
 		 467 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  42.37 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  42.68 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  40.72 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  41.16 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  38.71 
 
 		 465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  38.19 
 
 		 473 aa  339  5e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  38.38 
 
 		 468 aa  333  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  38.19 
 
 		 472 aa  323  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.2 
 
 		 345 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  36.07 
 
 		 464 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  35.28 
 
 		 467 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  35.71 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  35.12 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  35.33 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  36.46 
 
 		 464 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  34.49 
 
 		 470 aa  263  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  33.89 
 
 		 463 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  34.18 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  32.48 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  31 
 
 		 473 aa  216  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  30.74 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  31.37 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  32.2 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  30.15 
 
 		 481 aa  188  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  25.55 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  28.84 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.7 
 
 		 457 aa  170  4e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  27.27 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  26.11 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  25 
 
 		 576 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  24.77 
 
 		 585 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  25.36 
 
 		 576 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  26.67 
 
 		 533 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  26.36 
 
 		 533 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  25.16 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  25.1 
 
 		 504 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  24.68 
 
 		 579 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  26.36 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  25.54 
 
 		 575 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  24.47 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  25.97 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  24.84 
 
 		 592 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  24.44 
 
 		 576 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  26.01 
 
 		 525 aa  124  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  25.85 
 
 		 576 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  25.59 
 
 		 576 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  26.61 
 
 		 578 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  24.42 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  26.86 
 
 		 547 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  26.54 
 
 		 547 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  26.6 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  26.34 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  42.45 
 
 		 108 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  23.51 
 
 		 407 aa  92.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  22.72 
 
 		 591 aa  87.4  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  29.1 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  30 
 
 		 396 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  29.1 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  23.86 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  24.45 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  30.4 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  30.82 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  37.18 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.07 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1982  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.4 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  31.41 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.69 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.5 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.47 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  30.63 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.87 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.87 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  28.19 
 
 		 512 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.41 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  42.86 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  36.9 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  34.09 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.58 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  23.59 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  31.58 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.79 
 
 		 388 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  30.66 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.72 
 
 		 365 aa  53.9  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.9 
 
 		 375 aa  53.9  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.47 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.37 
 
 		 375 aa  53.5  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>