More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1982 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1982  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
376 aa  760    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1823  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.01 
 
 
369 aa  445  1.0000000000000001e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.248504  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.57 
 
 
399 aa  194  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.05 
 
 
395 aa  186  7e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.81 
 
 
398 aa  186  7e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.81 
 
 
399 aa  180  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.08 
 
 
410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 
431 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.18 
 
 
435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.3 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.18 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.15 
 
 
433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.88 
 
 
387 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.12 
 
 
413 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 
383 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  25.71 
 
 
380 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 
378 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 
383 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  26.61 
 
 
383 aa  106  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 
390 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  26.48 
 
 
383 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  26.48 
 
 
383 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  26.48 
 
 
383 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  26.48 
 
 
383 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  26.48 
 
 
383 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  28.09 
 
 
383 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.86 
 
 
404 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  29.06 
 
 
383 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  26.25 
 
 
364 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
382 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  26.59 
 
 
378 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  27.03 
 
 
394 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0954  peptidase dimerisation domain protein  29.46 
 
 
426 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  25.14 
 
 
378 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 
383 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 
383 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  25 
 
 
369 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  27.83 
 
 
389 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  26.97 
 
 
381 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  25.75 
 
 
390 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  26.17 
 
 
364 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 
383 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.77 
 
 
383 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 
383 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  28.77 
 
 
383 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 
383 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 
383 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.82 
 
 
423 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3712  putative acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases  28.99 
 
 
433 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.88 
 
 
423 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.15 
 
 
412 aa  99  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.88 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  29.34 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  28.65 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 
386 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  25 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.94 
 
 
409 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  25.59 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  26.37 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  26.26 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  25.7 
 
 
384 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  25.34 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.9 
 
 
391 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  26.09 
 
 
387 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 
423 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.32 
 
 
416 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  25.19 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.71 
 
 
370 aa  96.3  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 
396 aa  96.3  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  25.69 
 
 
387 aa  96.3  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  25.57 
 
 
384 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  25.14 
 
 
428 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.38 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  26.62 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  27.18 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  25.51 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.61 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  27.13 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  29.71 
 
 
383 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 
390 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  27.42 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.62 
 
 
422 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.36 
 
 
381 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 
387 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  26.43 
 
 
383 aa  94  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  25.9 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  25.9 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  29.9 
 
 
384 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.08 
 
 
400 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.12 
 
 
422 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.82 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  25.71 
 
 
405 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  26.17 
 
 
386 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.48 
 
 
393 aa  93.2  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  28.02 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  24.87 
 
 
391 aa  92.8  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  25.84 
 
 
586 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>