295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4535 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  93.16 
 
 		 468 aa  904    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  92.31 
 
 		 468 aa  899    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  90.59 
 
 		 345 aa  645    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  92.74 
 
 		 468 aa  901    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  92.74 
 
 		 468 aa  902    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  93.38 
 
 		 468 aa  907    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  92.74 
 
 		 468 aa  902    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  92.52 
 
 		 468 aa  900    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  79.27 
 
 		 467 aa  767    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  100 
 
 		 468 aa  956    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  62.69 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  56.41 
 
 		 469 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  43.01 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  42.58 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  42.58 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  45.36 
 
 		 464 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  43.75 
 
 		 464 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  43.19 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  41.81 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  40.95 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  41.06 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  40.34 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  40.67 
 
 		 473 aa  357  1.9999999999999998e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  40.79 
 
 		 468 aa  347  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  40.46 
 
 		 472 aa  330  4e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  37.61 
 
 		 465 aa  330  4e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  40.71 
 
 		 463 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  37.26 
 
 		 467 aa  322  6e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  33.89 
 
 		 476 aa  286  5.999999999999999e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  37.74 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  37.61 
 
 		 465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  30.08 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  34.02 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  97.2 
 
 		 108 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  32.27 
 
 		 449 aa  206  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  31.47 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.11 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  29.26 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  30.56 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  31.17 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  30.82 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  29.55 
 
 		 484 aa  170  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  28.97 
 
 		 579 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  29.18 
 
 		 575 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  27.71 
 
 		 592 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  28.43 
 
 		 576 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  29.81 
 
 		 504 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  26.09 
 
 		 576 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  25.52 
 
 		 576 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  28.5 
 
 		 576 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  25.86 
 
 		 585 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  28.74 
 
 		 534 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  31.03 
 
 		 525 aa  150  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  26.19 
 
 		 576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  28.13 
 
 		 579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  25.32 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  28.64 
 
 		 578 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  26.37 
 
 		 579 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  26.71 
 
 		 579 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  27.48 
 
 		 508 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  28.4 
 
 		 547 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  29.3 
 
 		 533 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  28.5 
 
 		 533 aa  126  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  27.92 
 
 		 547 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  28.5 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  27.21 
 
 		 547 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  27.38 
 
 		 591 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  24.94 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  32.74 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  25.6 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  21.72 
 
 		 415 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  28.84 
 
 		 237 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  21.97 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.16 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  21.61 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.46 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.92 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.56 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.62 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.92 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.56 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  33.07 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.21 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  29.37 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  27.03 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.22 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.95 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  38.27 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  39.02 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  43.48 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.58 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.58 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  35.35 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.26 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  40.85 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  27.5 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.51 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  40.24 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  40.85 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>