More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0135 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  100 
 
 		 473 aa  963    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  51.27 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  48.34 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  45.51 
 
 		 481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  34.1 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  32.63 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  32.77 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  32.36 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  32.5 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  32.08 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  32.7 
 
 		 467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  32.62 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  32.51 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  33.05 
 
 		 463 aa  216  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  31 
 
 		 469 aa  216  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  34.39 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  32.98 
 
 		 469 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  31.52 
 
 		 473 aa  213  7.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  30.98 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  30.64 
 
 		 467 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  33.48 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  30.84 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  31.8 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  31.55 
 
 		 468 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  31.47 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  32.17 
 
 		 468 aa  204  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  31.61 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  31.83 
 
 		 468 aa  200  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  31.83 
 
 		 468 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  31.25 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  30 
 
 		 469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  30 
 
 		 469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  31.61 
 
 		 468 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  31.4 
 
 		 468 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.46 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  31.12 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  30.89 
 
 		 449 aa  169  7e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  28.26 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  29.03 
 
 		 476 aa  156  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  27.27 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  28.1 
 
 		 576 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.8 
 
 		 345 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  28.1 
 
 		 576 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  28.27 
 
 		 450 aa  141  3e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  28.98 
 
 		 575 aa  140  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  27.7 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  27.91 
 
 		 579 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  28.51 
 
 		 508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  27.52 
 
 		 579 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  27.07 
 
 		 592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  32.02 
 
 		 525 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  26.83 
 
 		 504 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  27.75 
 
 		 579 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  25.3 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  28.51 
 
 		 533 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  27.61 
 
 		 547 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  26.15 
 
 		 576 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  28.43 
 
 		 533 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  27.2 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  27.54 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  27.9 
 
 		 533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  25.73 
 
 		 576 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  25.93 
 
 		 585 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  25.73 
 
 		 576 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  26.71 
 
 		 578 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  27.92 
 
 		 591 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  32.62 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  24.47 
 
 		 396 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  24.89 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  23.28 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.71 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  23.6 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  29.21 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.83 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.68 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1857  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.36 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2121  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.42 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  24.44 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  26.4 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  30.66 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  26.67 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  23.15 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  26.76 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  24.65 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.46 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  24.36 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1912  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.1 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2833  peptidase M20  31.01 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.03601  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  23.93 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  25.75 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  39.56 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  23.86 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.63 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.08 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  25.1 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  27.92 
 
 		 392 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  33.7 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  26.02 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  23.01 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  24.51 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>