239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1343 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  72 
 
 		 576 aa  866    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  71.83 
 
 		 576 aa  861    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  100 
 
 		 579 aa  1183    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  86.53 
 
 		 579 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  81 
 
 		 579 aa  983    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  73.04 
 
 		 576 aa  868    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  72 
 
 		 585 aa  864    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  40.73 
 
 		 579 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  42.22 
 
 		 592 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  39.12 
 
 		 575 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  39 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  38.89 
 
 		 576 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  39.88 
 
 		 591 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  31.82 
 
 		 504 aa  224  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  30.66 
 
 		 534 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  30.24 
 
 		 578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  31.27 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  30.36 
 
 		 508 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  29.92 
 
 		 547 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  29.72 
 
 		 547 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  30.56 
 
 		 533 aa  190  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  30.22 
 
 		 533 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  30.36 
 
 		 533 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  28.11 
 
 		 465 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  28 
 
 		 465 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  29.94 
 
 		 525 aa  170  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  27.22 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  29.12 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  29.08 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  26.5 
 
 		 471 aa  159  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  28.6 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  24.84 
 
 		 464 aa  151  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  26.6 
 
 		 470 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  26.94 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  28.29 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  27.42 
 
 		 465 aa  146  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  28.51 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  26.87 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  29.17 
 
 		 472 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  27.36 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  26.37 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  27.48 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  24.84 
 
 		 464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  27.72 
 
 		 468 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  28.33 
 
 		 468 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  27.72 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  27.83 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  24.77 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  24.72 
 
 		 473 aa  130  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  25.62 
 
 		 467 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  26.78 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  24.47 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  28.17 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  27.52 
 
 		 473 aa  123  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  24.63 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  24.63 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.47 
 
 		 345 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  22.74 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  25.78 
 
 		 481 aa  114  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  24.57 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  24.41 
 
 		 444 aa  103  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  24.9 
 
 		 481 aa  100  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  33.49 
 
 		 237 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  32.16 
 
 		 280 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  25.16 
 
 		 449 aa  95.1  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.43 
 
 		 457 aa  87.8  5e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  24.12 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  26.32 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  39.8 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  29.76 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.34 
 
 		 402 aa  62  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  30.51 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.93 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  27.85 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  30.51 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.32 
 
 		 405 aa  57  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  32.61 
 
 		 394 aa  57  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  28.35 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 386 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.04 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.41 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  37 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  30.94 
 
 		 480 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  30.36 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.4 
 
 		 488 aa  55.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.76 
 
 		 409 aa  54.3  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  26.4 
 
 		 404 aa  53.9  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.67 
 
 		 410 aa  53.9  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  26.94 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  26.94 
 
 		 471 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  27.97 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.19 
 
 		 455 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.92 
 
 		 508 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  30.97 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.68 
 
 		 402 aa  52.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 		 416 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02249  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.63 
 
 		 497 aa  52  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29911  predicted protein  35 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0349398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>