148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2626 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  100 
 
 
280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  95 
 
 
547 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  93.97 
 
 
547 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  98.11 
 
 
547 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  71.85 
 
 
533 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  71.85 
 
 
533 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  69.31 
 
 
533 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  66.82 
 
 
508 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  66.06 
 
 
534 aa  305  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  57.32 
 
 
578 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  51.42 
 
 
525 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  54.63 
 
 
504 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  33.66 
 
 
591 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  34.67 
 
 
576 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  34.67 
 
 
576 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  34.67 
 
 
585 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  33.67 
 
 
579 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  32.16 
 
 
579 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  31.6 
 
 
576 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  31.22 
 
 
579 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  31.05 
 
 
576 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  31.05 
 
 
576 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  29.44 
 
 
592 aa  92  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  31.68 
 
 
575 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  30.57 
 
 
579 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  31.46 
 
 
464 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  30.94 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  33.33 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  34.75 
 
 
467 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  26.9 
 
 
470 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  37.61 
 
 
467 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  33.33 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  38.89 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  36.94 
 
 
468 aa  72.4  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  27.23 
 
 
444 aa  72.4  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  30.23 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  31.39 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  31.39 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  36.52 
 
 
450 aa  70.5  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  32.74 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  32.74 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  26.6 
 
 
472 aa  69.7  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  32.74 
 
 
468 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  24.6 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  32.74 
 
 
468 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  32.74 
 
 
468 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  32.74 
 
 
468 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  32.74 
 
 
468 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  32.74 
 
 
468 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  32.62 
 
 
473 aa  68.9  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  32.74 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.86 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  32.33 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  26.23 
 
 
465 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  30.4 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  32.2 
 
 
468 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.45 
 
 
457 aa  64.7  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  33.91 
 
 
438 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  26.98 
 
 
476 aa  63.9  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  26.11 
 
 
465 aa  62.4  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  25.82 
 
 
465 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  26.85 
 
 
463 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  33.57 
 
 
451 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  25.77 
 
 
464 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  29.28 
 
 
396 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  27.85 
 
 
481 aa  57.4  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  31.21 
 
 
462 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  31.51 
 
 
462 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  30.82 
 
 
463 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  30.22 
 
 
396 aa  53.1  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.11 
 
 
445 aa  53.1  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  26.71 
 
 
481 aa  52.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  29.23 
 
 
451 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  26.67 
 
 
456 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  34.48 
 
 
468 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  23.5 
 
 
484 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  34.94 
 
 
426 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  32.74 
 
 
462 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.43 
 
 
424 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  32.74 
 
 
462 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  27.41 
 
 
457 aa  48.9  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  30.81 
 
 
461 aa  48.9  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  35.35 
 
 
457 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  35.35 
 
 
470 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  27.97 
 
 
448 aa  48.9  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  35.23 
 
 
410 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  36.14 
 
 
424 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  27.07 
 
 
469 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  31.33 
 
 
488 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  30.68 
 
 
432 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  33.33 
 
 
457 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  31.76 
 
 
433 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  27.75 
 
 
407 aa  46.2  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  31.71 
 
 
407 aa  45.4  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  33.62 
 
 
471 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  29.55 
 
 
432 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.51 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  30.59 
 
 
455 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 
432 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  33.62 
 
 
471 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>