65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2623 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  100 
 
 
237 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  99.16 
 
 
547 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  97.89 
 
 
547 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  97.89 
 
 
547 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  84.39 
 
 
533 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  84.39 
 
 
533 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  84.39 
 
 
533 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  71.79 
 
 
534 aa  343  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  70.89 
 
 
508 aa  339  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  62.03 
 
 
578 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  59.05 
 
 
525 aa  289  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  52.97 
 
 
504 aa  249  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  39.25 
 
 
576 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  36.7 
 
 
579 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  36.82 
 
 
592 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  37.17 
 
 
591 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  37.85 
 
 
576 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  35 
 
 
575 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  32.13 
 
 
464 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  32.54 
 
 
579 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  33.49 
 
 
579 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  31.02 
 
 
576 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  31.7 
 
 
579 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  31.63 
 
 
576 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  33.49 
 
 
576 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  33.49 
 
 
585 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  28.76 
 
 
465 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  29.18 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  27.23 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  28.88 
 
 
467 aa  75.5  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  30.53 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  26.41 
 
 
438 aa  72.8  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  26.07 
 
 
465 aa  72.8  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  29.15 
 
 
476 aa  70.1  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  29.27 
 
 
468 aa  67  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  30.23 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  32.14 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  28.7 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  28.84 
 
 
468 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  29.3 
 
 
468 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  25.58 
 
 
467 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  30.88 
 
 
468 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  30.7 
 
 
468 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  29.17 
 
 
467 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  26.21 
 
 
464 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  30.23 
 
 
468 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  30.7 
 
 
468 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  28.51 
 
 
464 aa  62.4  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  28.37 
 
 
468 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  26.67 
 
 
473 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  26.22 
 
 
450 aa  58.2  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  24.15 
 
 
449 aa  58.2  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  27.43 
 
 
481 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  25.54 
 
 
481 aa  57  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  26.46 
 
 
469 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  27.4 
 
 
469 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  27.4 
 
 
469 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  26.27 
 
 
470 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  24.46 
 
 
472 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  26.98 
 
 
469 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  25.71 
 
 
470 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  26.14 
 
 
473 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  28.18 
 
 
444 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  25.11 
 
 
484 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.77 
 
 
457 aa  43.9  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>