More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0677 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  100 
 
 		 469 aa  944    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  65.32 
 
 		 470 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  56.53 
 
 		 468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  56.96 
 
 		 468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  56.32 
 
 		 468 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  56.53 
 
 		 468 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  56.53 
 
 		 468 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  56.53 
 
 		 468 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  56.41 
 
 		 468 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  56.1 
 
 		 468 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  57.96 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  42.37 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  42.15 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  42.15 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.94 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  42.83 
 
 		 464 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  43.13 
 
 		 467 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  42.71 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  40.22 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  43.11 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  39.92 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  40.61 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  39.96 
 
 		 468 aa  359  5e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  39.52 
 
 		 465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  41.51 
 
 		 472 aa  358  1.9999999999999998e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  40.8 
 
 		 471 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  37.23 
 
 		 465 aa  346  4e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  37.29 
 
 		 463 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  36.21 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  36.34 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  34.26 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  34.99 
 
 		 465 aa  262  8e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  35.43 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  35.48 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  30.11 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  32.98 
 
 		 473 aa  213  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  29.23 
 
 		 438 aa  207  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  31.96 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  31.14 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.12 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  29.5 
 
 		 576 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  29.28 
 
 		 576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  29.78 
 
 		 575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  29.69 
 
 		 592 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  28.82 
 
 		 579 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  30.39 
 
 		 484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  27.04 
 
 		 576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  26.44 
 
 		 576 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  30.99 
 
 		 525 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  26.43 
 
 		 585 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  27.33 
 
 		 576 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  26.89 
 
 		 504 aa  156  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  28.95 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  73.2 
 
 		 108 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  29.64 
 
 		 578 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  28.04 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  28.29 
 
 		 579 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  27.1 
 
 		 579 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  27.56 
 
 		 591 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  26.87 
 
 		 508 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  28.5 
 
 		 533 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  28.44 
 
 		 533 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  28.11 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  25.64 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  27.23 
 
 		 547 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  26.77 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  26.83 
 
 		 547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.27 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.23 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  33.33 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  32.78 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.03 
 
 		 409 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  32.68 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.35 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  37.74 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  32.43 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.47 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.8 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  27.35 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.24 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  29.38 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  33.11 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0449  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.54 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.408478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  47.89 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.89 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  36.2 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.03 
 
 		 403 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  26.98 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  31.76 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  27.71 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.25 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  34.69 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  26.26 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.51 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.92 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  30.36 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  41.46 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.94 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.2 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.2 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>