110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2371 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  97.75 
 
 		 533 aa  1078    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1103    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  96.44 
 
 		 533 aa  1068    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  77.28 
 
 		 547 aa  838    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  66.4 
 
 		 534 aa  677    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  78.03 
 
 		 547 aa  846    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  64.34 
 
 		 508 aa  671    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  77.47 
 
 		 547 aa  842    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  60.2 
 
 		 578 aa  608  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  52.7 
 
 		 525 aa  535  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  49.32 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  84.39 
 
 		 237 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  71.85 
 
 		 280 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  32.8 
 
 		 592 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  32.33 
 
 		 576 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  30.98 
 
 		 591 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  30.65 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  31.69 
 
 		 576 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  29.87 
 
 		 575 aa  200  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  30.36 
 
 		 579 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  30.77 
 
 		 579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  29.74 
 
 		 576 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  28.97 
 
 		 576 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  30.1 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  29.86 
 
 		 579 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  30.1 
 
 		 585 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  29.3 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  27.8 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  27.59 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  29.51 
 
 		 467 aa  151  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  25.31 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  29.74 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  30.75 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  29.17 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  29.52 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  27.36 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  28.33 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  28.64 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  30.51 
 
 		 468 aa  134  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  30.75 
 
 		 468 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  30.05 
 
 		 468 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  30.75 
 
 		 468 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  30.27 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  30.53 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  26.55 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  30.02 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  26.67 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  28.44 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  25.12 
 
 		 463 aa  127  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  27.76 
 
 		 470 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  29.3 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  24.8 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  24.8 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  28.29 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  26.07 
 
 		 472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  25.41 
 
 		 473 aa  113  8.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  26.07 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  27.9 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  24.28 
 
 		 438 aa  111  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  25.93 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  22.94 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.47 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  26.89 
 
 		 481 aa  103  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.47 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  25.22 
 
 		 444 aa  91.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  25.38 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  23.45 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  22.66 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  33.33 
 
 		 451 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  30.91 
 
 		 462 aa  54.3  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  38.14 
 
 		 463 aa  54.3  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  30.77 
 
 		 396 aa  54.3  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.61 
 
 		 445 aa  52.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  31.03 
 
 		 461 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  38.38 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  34.38 
 
 		 433 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  38.55 
 
 		 424 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  35.71 
 
 		 468 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  30.13 
 
 		 396 aa  50.4  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  36.47 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  32.53 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  32.14 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  38.1 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  38.1 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  31.91 
 
 		 470 aa  47.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  32.26 
 
 		 457 aa  47.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  37.35 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  37.35 
 
 		 470 aa  47  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  27.23 
 
 		 471 aa  47  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  34.88 
 
 		 448 aa  47  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  27.23 
 
 		 471 aa  47  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  38.1 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  29.52 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  36.08 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  35.37 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  31.63 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  26.01 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.95 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  27.27 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>