More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1083 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  70.3 
 
 		 468 aa  695    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  100 
 
 		 468 aa  961    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  61.6 
 
 		 472 aa  578  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  49.04 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  47.75 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  44.66 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  44.65 
 
 		 473 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  41.1 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  41.14 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  42.64 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  42.64 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  42.64 
 
 		 468 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  42.86 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  42.43 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  42.64 
 
 		 468 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  42.8 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  41.7 
 
 		 468 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  42.64 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  40.21 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  40.21 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  41.56 
 
 		 469 aa  359  7e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  37.82 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  37.12 
 
 		 476 aa  311  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  39.62 
 
 		 470 aa  309  8e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  36.03 
 
 		 467 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  35.88 
 
 		 465 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  35.46 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  36.23 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.65 
 
 		 345 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  34.32 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  32.35 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  33.91 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  33.81 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  34.55 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  33.19 
 
 		 481 aa  209  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  28.3 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  31.81 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  30.53 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  31.01 
 
 		 450 aa  180  4.999999999999999e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  27.59 
 
 		 579 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  28.78 
 
 		 576 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  28.36 
 
 		 592 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  30.57 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  27.78 
 
 		 576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  28.81 
 
 		 575 aa  163  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.96 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  28.89 
 
 		 576 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  29.23 
 
 		 576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  28.01 
 
 		 576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  28.44 
 
 		 585 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  28.4 
 
 		 508 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  28.16 
 
 		 579 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  28.95 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  29.04 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  28.83 
 
 		 533 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  27.54 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  30.24 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  29.72 
 
 		 547 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  29.25 
 
 		 547 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  28.61 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  28.34 
 
 		 579 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  28.87 
 
 		 547 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  27.74 
 
 		 504 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  27.74 
 
 		 578 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  24.06 
 
 		 591 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  24.68 
 
 		 456 aa  114  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  50.59 
 
 		 108 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  22.63 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.59 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  36.11 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  22.45 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  36.94 
 
 		 280 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.07 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  35.19 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  28.44 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.5 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  42.55 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.36 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  30.15 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  39 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  36.59 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  30.41 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  36.67 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  47.14 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  35.65 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.85 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.1 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  37.78 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  31.16 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  23.52 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.86 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  44.29 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  34.62 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.97 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.92 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  30.43 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.78 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  27.91 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  29.71 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>