More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0709 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 415 aa  832    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  71.33 
 
 		 415 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  70.84 
 
 		 415 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  70.84 
 
 		 415 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  62.62 
 
 		 423 aa  524  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  39.33 
 
 		 396 aa  319  7e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  39.66 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  44.61 
 
 		 407 aa  305  7e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  39.28 
 
 		 421 aa  298  9e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  37.38 
 
 		 406 aa  289  7e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  37.84 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  38.14 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  36.83 
 
 		 410 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  33.49 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  34.71 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  38.26 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  33.98 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.65 
 
 		 411 aa  264  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  33.5 
 
 		 413 aa  260  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  39.65 
 
 		 411 aa  259  8e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.97 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.51 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.07 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.87 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.47 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  27.23 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.06 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.28 
 
 		 442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.53 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  25.83 
 
 		 586 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.46 
 
 		 375 aa  106  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  26.24 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.52 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  25.3 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.68 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  23.93 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  23.86 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  26.84 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.66 
 
 		 370 aa  101  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.9 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.54 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.78 
 
 		 376 aa  99.8  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.95 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3179  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.79 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.23 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.87 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.87 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  27.16 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  27.55 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.88 
 
 		 435 aa  97.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  26.25 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  27.35 
 
 		 432 aa  96.3  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  27.84 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.87 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  25.29 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.04 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  25.71 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  27.35 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.24 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.74 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.24 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  26.9 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.04 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.54 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.7 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.91 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  26.09 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  26.82 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  23.81 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.52 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  27.93 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  27.93 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  27.93 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.6 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.64 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  26.57 
 
 		 450 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  28.41 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  25.34 
 
 		 449 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  23.38 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1862  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.13 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000241136 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.7 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  27.49 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  27.65 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  25.74 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  23.25 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>