More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1971 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  100 
 
 		 476 aa  980    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  39.87 
 
 		 471 aa  342  1e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  39.02 
 
 		 468 aa  326  6e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  35.88 
 
 		 473 aa  324  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  38.08 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  36.29 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  37.82 
 
 		 467 aa  299  8e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  38.74 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  37.33 
 
 		 468 aa  297  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  36.21 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  36.4 
 
 		 470 aa  292  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  34.52 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  34.31 
 
 		 468 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  34.52 
 
 		 468 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  34.31 
 
 		 468 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  34.31 
 
 		 468 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  33.89 
 
 		 468 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  35.71 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  34.1 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  33.89 
 
 		 468 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  34.72 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  35.77 
 
 		 469 aa  282  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  35.77 
 
 		 469 aa  282  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  32.54 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.99 
 
 		 345 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  30.06 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  29.98 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  30.9 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  28.36 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  29.58 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  29.48 
 
 		 438 aa  187  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  31.37 
 
 		 449 aa  186  7e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  28.27 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  29.87 
 
 		 464 aa  179  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  30.5 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  29.03 
 
 		 473 aa  156  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  27.39 
 
 		 481 aa  143  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  27.61 
 
 		 579 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  28.63 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  26.67 
 
 		 592 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  26.7 
 
 		 504 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  26.47 
 
 		 576 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  28.33 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  26.2 
 
 		 576 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  26.28 
 
 		 575 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  27.1 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  28.08 
 
 		 533 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  28.08 
 
 		 533 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  27.5 
 
 		 484 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.03 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  26.35 
 
 		 576 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  25.99 
 
 		 525 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  26.3 
 
 		 576 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  26.49 
 
 		 547 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  26.12 
 
 		 585 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  25.78 
 
 		 578 aa  123  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  26.49 
 
 		 547 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  24.9 
 
 		 576 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  25.54 
 
 		 579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  25.93 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  25.61 
 
 		 534 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  26.47 
 
 		 508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  25.6 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  24.57 
 
 		 579 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  23.66 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  28.21 
 
 		 591 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  48.65 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  29.15 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6159  peptidase M20  31.45 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.757625  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  31.29 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  29.49 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  43.48 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  29.88 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  28.11 
 
 		 407 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.15 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1982  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.65 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  33.8 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  32.92 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  31.29 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  34.48 
 
 		 108 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  26.56 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  33.1 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  37.12 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  33.68 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  29.76 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  33.33 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  32.33 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  31.48 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  35.96 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  34.04 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  29.49 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  47.14 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  21.34 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.59 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  21.15 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  34.71 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  31.68 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  31.03 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  35.51 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>