More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0316 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
402 aa  802    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  30.95 
 
 
396 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.52 
 
 
398 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  31.41 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.53 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.95 
 
 
395 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.9 
 
 
399 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.54 
 
 
404 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.47 
 
 
426 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  26.11 
 
 
407 aa  106  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.58 
 
 
399 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.16 
 
 
391 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.15 
 
 
410 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.57 
 
 
375 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.47 
 
 
404 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.06 
 
 
391 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.07 
 
 
391 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 
395 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.79 
 
 
386 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.7 
 
 
397 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0954  peptidase dimerisation domain protein  27.18 
 
 
426 aa  99.8  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  25.54 
 
 
421 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  23.86 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.41 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.57 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  25.93 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  26.37 
 
 
415 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.03 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  25.06 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  27.59 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  26.85 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  25.21 
 
 
411 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.58 
 
 
389 aa  96.3  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.55 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.89 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0277  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.19 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  26.91 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.87 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7333  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.49 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.15 
 
 
383 aa  94  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2996  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.3 
 
 
381 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.61 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  23.6 
 
 
415 aa  93.6  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3336  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.49 
 
 
383 aa  93.6  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0627884 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.64 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.45 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 
379 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.1 
 
 
387 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.06 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.46 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.46 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  25.77 
 
 
446 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.73 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 
375 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.35 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.04 
 
 
437 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.74 
 
 
363 aa  90.1  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.56 
 
 
377 aa  90.1  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03183  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.96 
 
 
378 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  25.25 
 
 
409 aa  89.7  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.95 
 
 
398 aa  89  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.35 
 
 
395 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.94 
 
 
423 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.7 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.74 
 
 
363 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal  0.304299 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  24.13 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1271  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.73 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.78 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  24.79 
 
 
369 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  25.54 
 
 
446 aa  87.4  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.44 
 
 
469 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.61 
 
 
431 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.66 
 
 
376 aa  87  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  29.17 
 
 
394 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.23 
 
 
366 aa  87  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.68 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 
429 aa  86.7  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.33 
 
 
382 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26 
 
 
425 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.33 
 
 
382 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002797  N-succinyl-L,L-diaminopimelate desuccinylase  26.25 
 
 
378 aa  86.3  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1668  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
401 aa  86.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0474135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.13 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.06 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  26.06 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.1 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.66 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.46 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.18 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.82 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.72 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 
409 aa  84  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  24.82 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.29 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0672  peptidase M20  24.5 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>