More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0672 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0672  peptidase M20  100 
 
 
366 aa  744    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1019  peptidase dimerisation domain protein  56.87 
 
 
411 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  52.22 
 
 
363 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2473  peptidase M20  35.11 
 
 
356 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.27 
 
 
369 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  31.3 
 
 
400 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0327  Acetylornithine deacetylase/Succinyl- diaminopimelate desuccinylase and related deacylase-like protein  29.97 
 
 
434 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  30.63 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  29.32 
 
 
364 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.1 
 
 
378 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.7 
 
 
365 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  33.08 
 
 
364 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  33.08 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.66 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  28.46 
 
 
380 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.03 
 
 
413 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.5 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.43 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  31.05 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.34 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  24.92 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.53 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.36 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  28.72 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  27.3 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.43 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  29.72 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.54 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  29.13 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  27.71 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  28.19 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  28.62 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.49 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.05 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.41 
 
 
375 aa  69.3  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.05 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.62 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  24.68 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.13 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.07 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.52 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  25.94 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  26.36 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.84 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  29.3 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  25.52 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1531  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.18 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  23.54 
 
 
393 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.92 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 
385 aa  67  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.92 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  26.71 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.89 
 
 
405 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.35 
 
 
395 aa  67  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.35 
 
 
395 aa  67  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.85 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  23.85 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.28 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.09 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  27.18 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.74 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.46 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  25.41 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  27.46 
 
 
422 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.05 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3068  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.74 
 
 
389 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.76584  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  26.43 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  28.39 
 
 
389 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  28 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  27.72 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  24.27 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  26.92 
 
 
428 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  26.22 
 
 
383 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  27.2 
 
 
424 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.47 
 
 
389 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  26.94 
 
 
411 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  30 
 
 
450 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  26.28 
 
 
414 aa  63.5  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7333  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.61 
 
 
384 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  23.58 
 
 
423 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.78 
 
 
404 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.76 
 
 
391 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.72 
 
 
430 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  26.4 
 
 
383 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.93 
 
 
389 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.97 
 
 
376 aa  62.8  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.53 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  26.95 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  25.89 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  25.89 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.42 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>