More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1019 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1019  peptidase dimerisation domain protein  100 
 
 		 411 aa  820    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0672  peptidase M20  56.84 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  46.97 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2473  peptidase M20  35.73 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0327  Acetylornithine deacetylase/Succinyl- diaminopimelate desuccinylase and related deacylase-like protein  31.63 
 
 		 434 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  28.01 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  28.53 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  28.76 
 
 		 364 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  29.32 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.39 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  28.13 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  27.66 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.67 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.34 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.4 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  28.81 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.74 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  27.99 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  29.21 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.13 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.99 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  27.82 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  28.48 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  29.19 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.28 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  26.91 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.79 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  28.97 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.39 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.39 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.66 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  20.33 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  31.21 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  26.6 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  21.97 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.16 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  21.25 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  26.92 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  28.78 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  26.58 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0187608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.93 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.79 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.13 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.63 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.92 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.36 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  25.38 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  25.89 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.36 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.38 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  28.11 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  24.84 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.99 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  30.59 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.66 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.76 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.58 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  29.92 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  28.81 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  28.75 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  23.82 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  30.64 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.42 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.8 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.23 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  27.25 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.84 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0081  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.85 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  33.05 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.91 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  28.73 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  24.93 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.34 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  24.31 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.44 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.34 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.48 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.44 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.09 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  27.6 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.73 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  31.03 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.57 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  25.09 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  27.87 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.84 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.95 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.17 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  27.65 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  24.86 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.53 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.98 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3697  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  29.52 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  29.17 
 
 		 485 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>