More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1186 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  100 
 
 
363 aa  747    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0672  peptidase M20  52.22 
 
 
366 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1019  peptidase dimerisation domain protein  47.03 
 
 
411 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.43 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  29.73 
 
 
364 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0327  Acetylornithine deacetylase/Succinyl- diaminopimelate desuccinylase and related deacylase-like protein  29.38 
 
 
434 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2473  peptidase M20  31.36 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  29.72 
 
 
362 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  27.93 
 
 
365 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  27.54 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  31.14 
 
 
400 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.13 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  29.94 
 
 
364 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  29.63 
 
 
364 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.95 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  28.44 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  25.25 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 
387 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.36 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  27.96 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.35 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  26.87 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.47 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  25.13 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.3 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4229  peptidase M20  25.31 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.17 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.18 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.61 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  26.44 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  24.35 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  25 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.77 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.56 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.36 
 
 
431 aa  72.8  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  23.5 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  26.42 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  27.24 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  28.4 
 
 
409 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.99 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  25.57 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.55 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  31.17 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  29.65 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2177  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.6 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  25.26 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  24.55 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.84 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  26.52 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  31.58 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.48 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.95 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.74 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.18 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  27.51 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.01 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0081  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  28.47 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.87 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  26.07 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  25.58 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  26.07 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  26.07 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.84 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  25.21 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  23.97 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.73 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.68 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  24.68 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  24.45 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0187608 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  24.23 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  26.22 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.53 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  25.38 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.4 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  25.27 
 
 
394 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  24.84 
 
 
383 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  23.71 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.88 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  28.23 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  25.68 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.47 
 
 
375 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.82 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  25.48 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.45 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  25.44 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.11 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0792  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.57 
 
 
423 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1263  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.81 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103689  normal  0.466202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.39 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.58 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  23.97 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.93 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>