More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2417 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  100 
 
 		 383 aa  764    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  54.16 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  54.69 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  51.72 
 
 		 394 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  49.73 
 
 		 409 aa  323  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  46.04 
 
 		 405 aa  309  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  41.53 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  39.34 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  41.27 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  36.49 
 
 		 413 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  39.95 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  37.78 
 
 		 385 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  36.34 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  40.74 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  36.6 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  34.03 
 
 		 409 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  35 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.48 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  39.61 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  35.11 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  34.64 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  37.03 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  37.16 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  34.96 
 
 		 376 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  35.05 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  34.85 
 
 		 376 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  34.75 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  36.22 
 
 		 376 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  35.92 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  37.65 
 
 		 376 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  34.05 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  36.44 
 
 		 385 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  33.51 
 
 		 415 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  37.18 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  31.02 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  33.6 
 
 		 376 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  32.38 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  30.75 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  37.17 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.51 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  32.89 
 
 		 432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  36.02 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  30.59 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  30.46 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  33.69 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  33.69 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  29.95 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  37.5 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  38.1 
 
 		 420 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  36.24 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  33.6 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  35.75 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  36 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  29.69 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  29.08 
 
 		 436 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  29.08 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  31.32 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  36.12 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  32.17 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  30.62 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  33.51 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  36.41 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  35.29 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.84 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.84 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  28.95 
 
 		 438 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  28.5 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  29.82 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  32.9 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  27.39 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  27.65 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  34.23 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  28.53 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  29.97 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  27.56 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  28.57 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  27.63 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  28.61 
 
 		 441 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  31.82 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.95 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.64 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  29 
 
 		 436 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  28.95 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  27.01 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  28.13 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  25.26 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.52 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  25.13 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  29.39 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  31.17 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.15 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  28.91 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  27.15 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>